RNA–Protein interactions for RNA: YJL097W

PHS1, Transcript of Essential 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase of the ER membrane, yeast

Gene PHS1, Length 654 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PHS1	YJL097W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.44	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	MGT1	P26188	188 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	AHT1	P29589	182 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	YIL102C	P40488	101 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	TDA4	P47153	279 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	MMS2	P53152	137 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	YMR253C	Q04835	414 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	YLR031W	Q07978	186 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	CCW12	Q12127	133 aa		0.43	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	TIR1	P10863	254 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	SNF4	P12904	322 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	CBF1	P17106	351 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	YCR023C	P25351	611 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	DCV1	P43595	202 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	COX12	Q01519	83 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	FYV12	Q08559	129 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	GET4	Q12125	312 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	YOR015W	Q12169	119 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	NMT1	P14743	455 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	SPC25	P40014	221 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	NAT3	Q06504	195 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	IGO2	Q9P305	131 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PHS1	YJL097W	STF2	P16965	84 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YBL010C	P32788	280 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	ETR1	P38071	380 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	RCF2	P53721	224 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YNL184C	P53876	108 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	GRX5	Q02784	150 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YDR102C	Q03864	110 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YDR278C	Q05612	105 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	MRS4	P23500	304 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	PTC1	P35182	281 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	MPM1	P40364	252 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YFL019C	P43576	117 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YGL235W	P53071	178 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	FIT1	Q04433	528 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	NTG1	P31378	399 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YAR064W	P39563	99 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	DAS2	Q12084	232 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	DGK1	Q12382	290 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YOR343C	Q12484	108 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	QCR7	P00128	127 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	KIN28	P06242	306 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YCR001W	P25347	104 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YJR015W	P47090	510 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	SBH1	P52870	82 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	NRK1	P53915	240 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YDC1	Q02896	317 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	UPS1	Q05776	175 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	IRC19	Q07843	230 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	ATP20	Q12233	115 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	NSE4	P43124	402 aa		0.35	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YGR017W	P53210	297 aa		0.35	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	PGA1	P53896	198 aa		0.35	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	HHT1	P61830	136 aa		0.35	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	TMA23	Q03525	211 aa		0.35	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	DML1	Q03652	475 aa		0.35	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	ELP6	Q04868	273 aa		0.35	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	KEI1	Q06346	221 aa		0.35	□□□□□ -2.35
PHS1	YJL097W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PHS1	YJL097W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
PHS1	YJL097W	ECM31	P38122	312 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PHS1	YJL097W	RRT1	P38192	103 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PHS1	YJL097W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
PHS1	YJL097W	YGL230C	P53074	147 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PHS1	YJL097W	CGR1	P53188	120 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PHS1	YJL097W	LCL1	Q02786	101 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PHS1	YJL097W	SGF11	Q03067	99 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PHS1	YJL097W	AIM34	Q03673	198 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PHS1	YJL097W	GAL83	Q04739	417 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PHS1	YJL097W	VAM10	Q08474	114 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PHS1	YJL097W	ATG41	Q12048	136 aa		0.34	□□□□□ -2.36
PHS1	YJL097W	COX5B	P00425	151 aa		0.33	□□□□□ -2.36

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