RNA–Protein interactions for RNA: YDL084W

SUB2, Transcript of Component of the TREX complex required for nuclear mRNA export, yeast

Gene SUB2, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUB2	YDL084W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	BUD3	P25558	1636 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	MDH2	P22133	377 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	SWD3	P38123	315 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	UMP1	P38293	148 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YBR292C	P38357	123 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	TIM17	P39515	158 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YGL262W	P53054	175 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YGR018C	P53211	109 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	ATG41	Q12048	136 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	RIM15	P43565	1770 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SUB2	YDL084W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	MAK32	P23060	363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	PIR5	P46999	287 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	SPG1	P50088	95 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YGR050C	P53231	118 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	MIX14	Q04341	121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YHL042W	P38729	150 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	HSP10	P38910	106 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	SNF11	P38956	169 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	DFG10	P40526	253 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	COX12	Q01519	83 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YML053C	Q04978	212 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	NDD1	Q08887	554 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	EMC6	Q12431	108 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	COX19	Q3E731	98 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	BET1	P22804	142 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	OM14	P38325	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	RIM9	Q04734	239 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	ELP6	Q04868	273 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	ODC2	Q99297	307 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	MOT1	P32333	1867 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	SEC11	P15367	167 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	ERG4	P25340	473 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YKL097C	P34245	136 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	RIM2	P38127	377 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YFR035C	P43608	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	VPS25	P47142	202 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	FHN1	P53279	174 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	HAL1	Q01766	294 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	LDB16	P25587	256 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	PCL5	P38794	229 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	CDC1	P40986	491 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	HPA2	Q06592	156 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	ANS1	P38832	159 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	SYM1	Q06563	197 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	ATO3	Q12359	275 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	GSC2	P40989	1895 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	SPS100	P13130	326 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	YJL028W	P47062	111 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	RRT7	Q07829	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUB2	YDL084W	RRT13	P40042	185 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	PGU1	P47180	361 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YGR045C	P53229	120 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YNR064C	P53750	290 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YCR006C	P25350	157 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	RPP1	P38786	293 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	TDA2	P40045	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	TPC1	P53257	314 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SUB2	YDL084W	PCP1	P53259	346 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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