RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 MMS19Q96T76 1030 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 SYT15Q9BQS2 421 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC46A2Q9BY10 475 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 HPSEQ9Y251 543 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 R4GN57 208 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 DMDP11532 3685 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 VPS13AQ96RL7 3174 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRVP-204ENST00000639439 MYBPHLA2RUH7 354 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 TACC1O75410 805 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 PRAMEF12O95522 483 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 ATICP31939 592 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 GPR15P49685 360 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 AP3M2P53677 418 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 TRPC3Q13507 836 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 DDR2Q16832 855 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 VSTM1Q6UX27 236 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 MAMSTRQ6ZN01 415 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM150AQ86TG1 271 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 MON1AQ86VX9 555 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 MYRFLQ96LU7 910 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 LRRC3BQ96PB8 259 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 CHRDQ9H2X0 955 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 SNX25Q9H3E2 840 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 KIF9Q9HAQ2 790 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 ZDHHC9Q9Y397 364 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 COL4A3Q01955 1670 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC38A8A6NNN8 435 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 KIF20AO95235 890 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 CST3P01034 146 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 CCNE1P24864 410 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 SYKP43405 635 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 TNNC1P63316 161 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 STK4Q13043 487 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 LRRC32Q14392 662 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 PPP2R5DQ14738 602 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 KMT5BQ4FZB7 885 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 GPIHBP1Q8IV16 184 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 SCN4BQ8IWT1 228 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 ADSSL1Q8N142 457 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 MAB21L3Q8N8X9 362 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 LMAN1LQ9HAT1 526 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 PDXKO00764 312 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 HCRTO43612 131 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 KINO60870 393 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 PHACTR2O75167 634 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 LMO2P25791 158 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 MTAPQ13126 283 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 WDR72Q3MJ13 1102 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 FSIP1Q8NA03 581 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 MYLPFQ96A32 169 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 SPATA17Q96L03 361 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 TDP1Q9NUW8 608 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 DMAC2Q9NW81 257 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 ZSCAN32Q9NX65 697 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 EHD2Q9NZN4 543 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 COL4A2P08572 1712 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A1W2PQ27 194 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A1W2PQ64 194 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A1W2PQD8 194 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 ATP2C2O75185 946 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 RPN1P04843 607 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 PDGFRBP09619 1106 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 CHRNB1P11230 501 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 CTHP32929 405 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 CCR3P51677 355 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 CLDN10P78369 228 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 TXNDC8Q6A555 127 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 OR6B3Q8NGW1 331 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 ATRIPQ8WXE1 791 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF516Q92618 1163 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC34Q96HJ3 373 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRVP-204ENST00000639439 ZFYVE19Q96K21 471 aa16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms