RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	MROH9	Q5TGP6	573 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	VSTM1	Q6UX27	236 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	PTPRN2	Q92932	1015 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624		A0A1W2PPM1	405 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ATIC	P31939	592 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	OCRL	Q01968	901 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	CCDC80	Q76M96	950 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	CYP4X1	Q8N118	509 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	NRBF2	Q96F24	287 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	CYLD	Q9NQC7	956 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	RREB1	Q92766	1687 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ZBED1	O96006	694 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	NUDT2	P50583	147 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	CASP5	P51878	434 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	CHADL	Q6NUI6	762 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	TTC27	Q6P3X3	843 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		12.69	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	MED24	O75448	989 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	KLHL2	O95198	593 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	OCM2	P0CE71	109 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	PSMA2	P25787	234 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	PRKCI	P41743	596 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	KCNA1	Q09470	495 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	FUT2	Q10981	343 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ZNF786	Q8N393	782 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	GIPC3	Q8TF64	312 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ING2	Q9H160	280 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	USP20	Q9Y2K6	914 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	C4A	P0C0L4	1744 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ZBTB5	O15062	677 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	RFX1	P22670	979 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	NCKAP1L	P55160	1127 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	EPHA7	Q15375	998 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	SLC1A5	Q15758	541 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	USP6NL	Q92738	828 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	GID8	Q9NWU2	228 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	TNFAIP8	O95379	198 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	KRT75	O95678	551 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	AMPD1	P23109	780 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	PTGER2	P43116	358 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	KRT39	Q6A163	491 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ABHD8	Q96I13	439 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	SYT17	Q9BSW7	474 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	AURKC	Q9UQB9	309 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	GINS2	Q9Y248	185 aa		12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	TAF1	P21675	1872 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ADAMTS3	O15072	1205 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	SLC16A4	O15374	487 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	CYTH3	O43739	400 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ECE1	P42892	770 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	MPP3	Q13368	585 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	CDO1	Q16878	200 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		12.67	□□□□□ -0.38
PXN-222	ENST00000637624	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		12.67	□□□□□ -0.38

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