RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637140.1

ATP6AP2-222, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 2, human

TSL 2

Gene ATP6AP2, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PROZ	P22891	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ECHS1	P30084	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	BMPR1A	P36894	532 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GPR3	P46089	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CLRN1	P58418	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	USP34	Q70CQ2	3546 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	REV3L	O60673	3130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PRKD3	O94806	890 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SGPL1	O95470	568 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CCL5	P13501	91 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CNGA1	P29973	690 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SREBF1	P36956	1147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TAP1	Q03518	808 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GRAP	Q13588	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NUP98	P52948	1817 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	LMO1	P25800	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MCAM	P43121	646 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CHN2	P52757	468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SLC5A3	P53794	718 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PER3	P56645	1201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TEF	Q10587	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MALL	Q13021	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	SP140	Q13342	867 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	NEU1	Q99519	415 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	LAMB1	P07942	1786 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	AOX1	Q06278	1338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	ADRA1B	P35368	520 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATP6AP2-222	ENST00000637140	MTNR1B	P49286	362 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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