RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 NR1H3Q13133 447 aa29.44■■■□□ 2.3
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CAPNS1-217ENST00000629983 SPAG17Q6Q759 2223 aa29.44■■■□□ 2.3
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CAPNS1-217ENST00000629983 SEC13P55735 322 aa29.42■■■□□ 2.3
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CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf127Q8N9H9 656 aa29.35■■■□□ 2.29
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CAPNS1-217ENST00000629983 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
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CAPNS1-217ENST00000629983 CEACAM1P13688 526 aa29.34■■■□□ 2.29
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