RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 XKR4Q5GH76 650 aa22.9■■□□□ 1.26
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SGMS1-210ENST00000619438 FUT10Q6P4F1 479 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 FAM212AQ96EL1 285 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 AGPAT1Q99943 283 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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SGMS1-210ENST00000619438 KCNE1P15382 129 aa22.89■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 TNFSF9P41273 254 aa22.89■■□□□ 1.25
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SGMS1-210ENST00000619438 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.89■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.89■■□□□ 1.25
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SGMS1-210ENST00000619438 FAM50BQ9Y247 325 aa22.89■■□□□ 1.25
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SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.88■■□□□ 1.25
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SGMS1-210ENST00000619438 CYP24A1Q07973 514 aa22.88■■□□□ 1.25
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SGMS1-210ENST00000619438 GPD1LQ8N335 351 aa22.88■■□□□ 1.25
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SGMS1-210ENST00000619438 EHD2Q9NZN4 543 aa22.87■■□□□ 1.25
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SGMS1-210ENST00000619438 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.87■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 LACTBL1A8MY62 500 aa22.86■■□□□ 1.25
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SGMS1-210ENST00000619438 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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SGMS1-210ENST00000619438 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.86■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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SGMS1-210ENST00000619438 CHST7Q9NS84 486 aa22.86■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.86■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 TRAPPC3O43617 180 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 LRRN2O75325 713 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 DSG1Q02413 1049 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 PEX26Q7Z412 305 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-210ENST00000619438 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.85■■□□□ 1.25
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