RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 TADA3O75528 432 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 IDEP14735 1019 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 ARSAP15289 507 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 AMPD2Q01433 879 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 OSTM1Q86WC4 334 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 PDE11AQ9HCR9 933 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 SIX4Q9UIU6 781 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 SNX9Q9Y5X1 595 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 CACNA1BQ00975 2339 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PTPRF-216ENST00000617451 OBSL1O75147 1896 aa26.76■■□□□ 1.88
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PTPRF-216ENST00000617451 ATG13O75143 517 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 RBP5P82980 135 aa26.76■■□□□ 1.87
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PTPRF-216ENST00000617451 KRT19P08727 400 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 STAT6P42226 847 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 LHX1P48742 406 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 PXNP49023 591 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
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PTPRF-216ENST00000617451 CFAP221Q4G0U5 840 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 ADGRF2Q8IZF7 708 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 GAB3Q8WWW8 586 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 PANK2Q9BZ23 570 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 MTMR12Q9C0I1 747 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 PCIF1Q9H4Z3 704 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM206Q9H813 350 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 PANK4Q9NVE7 773 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 SLC8A2Q9UPR5 921 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 A0A087X0B3 334 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 EGFP01133 1207 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 SYT1P21579 422 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 PCSK1P29120 753 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 GALK1P51570 392 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 FAM160A1Q05DH4 1040 aa26.74■■□□□ 1.87
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PTPRF-216ENST00000617451 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
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PTPRF-216ENST00000617451 HCRTO43612 131 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 RNF40O75150 1001 aa26.73■■□□□ 1.87
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PTPRF-216ENST00000617451 TMEM191BP0C7N4 346 aa26.73■■□□□ 1.87
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PTPRF-216ENST00000617451 FAM171BQ6P995 826 aa26.73■■□□□ 1.87
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PTPRF-216ENST00000617451 CYP2S1Q96SQ9 504 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 TRPC7Q9HCX4 862 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 SPAG17Q6Q759 2223 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 AXIN1O15169 862 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 SLC39A14Q15043 492 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF77Q15935 545 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 PPM1JQ5JR12 505 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 DPH6Q7L8W6 267 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 LIMS2Q7Z4I7 341 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 CPA6Q8N4T0 437 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 CAMKK1Q8N5S9 505 aa26.72■■□□□ 1.87
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PTPRF-216ENST00000617451 P2RY13Q9BPV8 354 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 ECT2Q9H8V3 914 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 INTS13Q9NVM9 706 aa26.72■■□□□ 1.87
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PTPRF-216ENST00000617451 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa26.71■■□□□ 1.87
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PTPRF-216ENST00000617451 USP17L7P0C7H9 530 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEA11P43364 429 aa26.71■■□□□ 1.87
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PTPRF-216ENST00000617451 FBXO43Q4G163 708 aa26.71■■□□□ 1.87
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PTPRF-216ENST00000617451 KBTBD6Q86V97 674 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 SCN4BQ8IWT1 228 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 EXOC4Q96A65 974 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 GCNT4Q9P109 453 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRF-216ENST00000617451 PTPRJQ12913 1337 aa26.7■■□□□ 1.87
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