RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.21■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.21■■□□□ 1.15
CSAG3-202ENST00000617158 FAM170AA1A519 330 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 URODP06132 367 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 UBE3AQ05086 875 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 GPM6BQ13491 265 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 PASD1Q8IV76 773 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 TIFAQ96CG3 184 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 PLXNA3P51805 1871 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 A0A1W2PPC1 479 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 WDR27A2RRH5 827 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 HIDE1A8MVS5 230 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 TULP2O00295 520 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 GABBR2O75899 941 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 CXCL14O95715 111 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 TNFAIP3P21580 790 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 ADORA2BP29275 332 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 OR1D2P34982 312 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 KIF11P52732 1056 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 NOMO3P69849 1222 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 TSPY1Q01534 308 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 ROR1Q01973 937 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 GPR17Q13304 367 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 FAM35AQ86V20 835 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 UBA3Q8TBC4 463 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 FNIP2Q9P278 1114 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 STK39Q9UEW8 545 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 IRAK3Q9Y616 596 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 RFXAPO00287 272 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 TEX28O15482 410 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 LPXNO60711 386 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 BEST1O76090 585 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 LCA5LO95447 670 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 CNPP09543 421 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 GPD2P43304 727 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 ARPP19P56211 112 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 SMOQ99835 787 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 TCF25Q9BQ70 676 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 LHX5Q9H2C1 402 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 TLR9Q9NR96 1032 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 MTMR11A4FU01 709 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 MED7O43513 233 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 ABLIM3O94929 683 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 NDUFA10O95299 355 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 ANXA13P27216 316 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 CYP27A1Q02318 531 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 RAB33AQ14088 237 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 SLC18A3Q16572 532 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 TMC7Q7Z402 723 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC42Q96M95 316 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 NAGPAQ9UK23 515 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 PATJQ8NI35 1801 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 M0QYV0 167 aa22.16■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 CSPG5O95196 566 aa22.16■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 BDNFP23560 247 aa22.16■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 CYP2F1P24903 491 aa22.16■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 PDE4CQ08493 712 aa22.16■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 STILQ15468 1287 aa22.16■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 NAA35Q5VZE5 725 aa22.16■■□□□ 1.14
CSAG3-202ENST00000617158 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms