RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616702.1

CCL3L3-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 2

Gene CCL3L3, Length 548 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-202ENST00000616702 CSH1P0DML2 217 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 CSH2P0DML3 217 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 NUCB2P80303 420 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 CYP27A1Q02318 531 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 CEP135Q66GS9 1140 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 NELL2Q99435 816 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 IL21Q9HBE4 155 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 ABCB6Q9NP58 842 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 NOTCH4Q99466 2003 aa14.56□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 SCN1AP35498 2009 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 MAN2B1O00754 1011 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 PDXKO00764 312 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 NR3C1P04150 777 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 GLULP15104 373 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 AVPR1AP37288 418 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 GRIK1P39086 918 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 AP3M2P53677 418 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 NLRP12P59046 1061 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 MYL6P60660 151 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 DPYDQ12882 1025 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 FAM171BQ6P995 826 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 MYLPFQ96A32 169 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 PKMYT1Q99640 499 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 DMAC2Q9NW81 257 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 NCANO14594 1321 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 TSC2P49815 1807 aa14.55□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 A8MXQ7 604 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 CHADO15335 359 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 GFRA3O60609 400 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 TACC1O75410 805 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 RHOBTB3O94955 611 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 BDNFP23560 247 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 ATICP31939 592 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 LIMS2Q7Z4I7 341 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 TTC8Q8TAM2 541 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 FAM3CQ92520 227 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 ZFYVE19Q96K21 471 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 NOL4O94818 638 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 PRAMEF12O95522 483 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 F11P03951 625 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 ANXA13P27216 316 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 NBL1P41271 181 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 DLG4P78352 724 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 NCOA4Q13772 614 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 ZNF699Q32M78 642 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 TXNDC8Q6A555 127 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 TTC16Q8NEE8 873 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 PCED1BQ96HM7 432 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.53□□□□□ -0.08
CCL3L3-202ENST00000616702 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms