RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 DCAF6Q58WW2 860 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC7A14Q8TBB6 771 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP1R37O75864 691 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SOAT2O75908 522 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CDC73Q6P1J9 531 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TPD52L3Q96J77 140 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ECDO95905 644 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM179Q6ZVK1 233 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 KRT35Q92764 455 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP2R3CQ969Q6 453 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CCT8P50990 548 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CAMKK1Q8N5S9 505 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM79Q9BSE2 394 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 EFCAB10A6NFE3 127 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SCGNO76038 276 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 MYL12AP19105 171 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ALDH1A3P47895 512 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 UPP2O95045 317 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TAB1Q15750 504 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ERFEQ4G0M1 354 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ULK3Q6PHR2 472 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM129BQ96TA1 746 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SCUBE2Q9NQ36 999 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ZBTB5O15062 677 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 IFNAR1P17181 557 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SCARA3Q6AZY7 606 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SLITRK2Q9H156 845 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 POLR1DQ9Y2S0 133 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 GRK4P32298 578 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 GRK3P35626 688 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CRKLP46109 303 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 USPL1Q5W0Q7 1092 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 BHMTQ93088 406 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CRLS1Q9UJA2 301 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM120BA0PK00 339 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TSPAN9O75954 239 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 IL5RAQ01344 420 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 STX5Q13190 355 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TINF2Q9BSI4 451 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ING3Q9NXR8 418 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TRPC4Q9UBN4 977 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SNX13Q9Y5W8 968 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ERBB3P21860 1342 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SFNP31947 248 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TAF5Q15542 800 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 DGKDQ16760 1214 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 GATAD2AQ86YP4 633 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ZHX2Q9Y6X8 837 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 USP17L5A8MUK1 530 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF24P17028 368 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 RHAGQ02094 409 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TOMM20Q15388 145 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP19.28■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 107.1
PTPRJ-207ENST00000613246 A2MP01023 1474 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CCT8L1PA6NM43 557 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CLPTM1O96005 669 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 FCER1AP12319 257 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 DPYDQ12882 1025 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 RESTQ13127 1097 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CDK20Q8IZL9 346 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TAF13Q15543 124 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TTLL9Q3SXZ7 439 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM20BO75063 409 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ACADSP16219 412 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 LPCAT2Q7L5N7 544 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 E2F7Q96AV8 911 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM117Q9H0C3 514 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 ARMC7Q9H6L4 198 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXO40Q9UH90 709 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CCNG1P51959 295 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 MIEF1Q9NQG6 463 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1W2PRG6 482 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 CLYBLQ8N0X4 340 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM49BQ9NUQ9 324 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 NR5A2O00482 541 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 PSMB9P28065 219 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM51Q9BSJ1 452 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms