RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 PDGFRBP09619 1106 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT3P12035 628 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 COMTP21964 271 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 GPD2P43304 727 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 RWDD2BP57060 319 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ORC1Q13415 861 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ACAP1Q15027 740 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ACTRT1Q8TDG2 376 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 HSFY1Q96LI6 401 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSWIM1Q9BR11 485 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 ST7Q9NRC1 585 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF19AQ9NV58 838 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 SCN1AP35498 2009 aa23.89■■□□□ 1.42
CAPNS1-212ENST00000591041 SIGLEC16A6NMB1 481 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 GABRDO14764 452 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SRGAP2O75044 1071 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CFHP08603 1231 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 DNA2P51530 1060 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPY1Q01534 308 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX35Q5T0J7 233 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 WSCD1Q658N2 575 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CREG2Q8IUH2 290 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 RHOT1Q8IXI2 618 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 FNIP1Q8TF40 1166 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 MED10Q9BTT4 135 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHB8Q9UN66 801 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 H0YGN5 161 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 M0QZQ0 153 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PSTPIP1O43586 416 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PFKMP08237 780 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SCNN1AP37088 669 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 RUBCNQ92622 972 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SUSD3Q96L08 255 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMB7Q99436 277 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SYT15Q9BQS2 421 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 ACBD6Q9BR61 282 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.88■■□□□ 1.414e-6■□□□□ 9.2
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM49BQ9NUQ9 324 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM191CA6NGB0 347 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC188H7C350 402 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TADA2AO75478 443 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CXCR5P32302 372 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 OR1G1P47890 313 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PLCB3Q01970 1234 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 DSC1Q08554 894 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 HADHQ16836 314 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPN20Q4JDL3 420 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 UBA3Q8TBC4 463 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TBX21Q9UL17 535 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SART1O43290 800 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF8O76064 485 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 ALDH2P05091 517 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM200BP0CF97 657 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 FGFR1P11362 822 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SSR1P43307 286 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CCL23P55773 120 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CLLU1OSQ5K130 101 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC38Q5VT99 294 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 OR6B2Q6IFH4 312 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM199Q8N511 208 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 NIPA2Q8N8Q9 360 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 C12orf29Q8N999 325 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 COG1Q8WTW3 980 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 MCEEQ96PE7 176 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA8SH3BPF8 625 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 ADORA2BP29275 332 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TIGD5Q53EQ6 642 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM110Q86TL2 294 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 XYLT1Q86Y38 959 aa23.85■■□□□ 1.41
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