RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ANO3Q9BYT9 981 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 RSAD1Q9HA92 442 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CHST7Q9NS84 486 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TBX21Q9UL17 535 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ALPK3Q96L96 1907 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 NID2Q14112 1375 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 H0Y8X5 98 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 HAS3O00219 553 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 B4GALT4O60513 344 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TLR5O60602 858 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ARP10275 920 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ITGB8P26012 769 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 SREBF1P36956 1147 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 GRK6P43250 576 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 MZT2AQ6P582 158 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 SESTD1Q86VW0 696 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TDHQ8IZJ6 230 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 C7orf31Q8N865 590 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CCT6BQ92526 530 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 WASF1Q92558 559 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM169Q96HH4 297 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR20Q99678 358 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CENPFP49454 3210 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 RASA4BC9J798 803 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 RASA4O43374 803 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 FGBP02675 491 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 AGXTP21549 392 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP2C18P33260 490 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 FPGSQ05932 587 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 BFSP2Q13515 415 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 SHHQ15465 462 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 PTGISQ16647 500 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ME3Q16798 604 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 DGKKQ5KSL6 1271 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CDH24Q86UP0 819 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC103Q8IW40 242 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CMIPQ8IY22 773 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 BLIDQ8IZY5 108 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 NECAB1Q8N987 351 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP2W1Q8TAV3 490 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 PGBD1Q96JS3 809 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 NUP62CLQ9H1M0 184 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 HIPK3Q9H422 1215 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TBC1D22BQ9NU19 505 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 FNIP2Q9P278 1114 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 KAT6AQ92794 2004 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC12A8A0AV02 714 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 LGALS2P05162 132 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 GNAT1P11488 350 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP2C9P11712 490 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNA2P16389 499 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CIITAP33076 1130 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 ASPAP45381 313 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 SEPHS1P49903 392 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 CCL23P55773 120 aa8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
EFTUD2-216ENST00000590105 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms