RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.74□□□□□ -1.33
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TSG101-211ENST00000580814 SNX22Q96L94 193 aa6.74□□□□□ -1.33
TSG101-211ENST00000580814 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.74□□□□□ -1.33
TSG101-211ENST00000580814 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.74□□□□□ -1.33
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TSG101-211ENST00000580814 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
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TSG101-211ENST00000580814 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.73□□□□□ -1.33
TSG101-211ENST00000580814 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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TSG101-211ENST00000580814 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.73□□□□□ -1.33
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TSG101-211ENST00000580814 LZTS1Q9Y250 596 aa6.73□□□□□ -1.33
TSG101-211ENST00000580814 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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TSG101-211ENST00000580814 AREL1O15033 823 aa6.72□□□□□ -1.33
TSG101-211ENST00000580814 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TSG101-211ENST00000580814 CDKL5O76039 1030 aa6.72□□□□□ -1.33
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TSG101-211ENST00000580814 LRPAP1P30533 357 aa6.72□□□□□ -1.33
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TSG101-211ENST00000580814 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.72□□□□□ -1.33
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TSG101-211ENST00000580814 FAM163BP0C2L3 166 aa6.71□□□□□ -1.34
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TSG101-211ENST00000580814 CCDC96Q2M329 555 aa6.71□□□□□ -1.34
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TSG101-211ENST00000580814 PLA1AQ53H76 456 aa6.71□□□□□ -1.34
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TSG101-211ENST00000580814 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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TSG101-211ENST00000580814 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.71□□□□□ -1.34
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TSG101-211ENST00000580814 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.71□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 DMTF1Q9Y222 760 aa6.71□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.7□□□□□ -1.34
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TSG101-211ENST00000580814 CLCA1A8K7I4 914 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 CCP110O43303 1012 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 THAP12O43422 761 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 NCK2O43639 380 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 TRIAP1O43715 76 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 INMTO95050 263 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 ADRB1P08588 477 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 VDRP11473 427 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 CHRM3P20309 590 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 GATA3P23771 443 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 NPTX2P47972 431 aa6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TSG101-211ENST00000580814 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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