RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HPDLQ96IR7 371 aa30.27■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TDP1Q9NUW8 608 aa30.27■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GABRDO14764 452 aa30.26■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP30.26■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HOXD13P35453 343 aa30.26■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DUOXA2Q1HG44 320 aa30.26■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM26FQ5R3K3 315 aa30.26■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIF9Q9HAQ2 790 aa30.26■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIAA1586Q9HCI6 787 aa30.26■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GMEB2Q9UKD1 530 aa30.26■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NOL4O94818 638 aa30.25■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP30.25■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LPAL2Q16609 132 aa30.25■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CFAP221Q4G0U5 840 aa30.25■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa30.25■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MON1AQ86VX9 555 aa30.25■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SCN4BQ8IWT1 228 aa30.25■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM83CQ9BQN1 747 aa30.25■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCINQ13939 588 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRIM68Q6AZZ1 485 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRR23BQ6ZRT6 265 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DPH6Q7L8W6 267 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WDR49Q8IV35 697 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RDH13Q8NBN7 331 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF507Q8TCN5 953 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SYT15Q9BQS2 421 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EBF3Q9H4W6 596 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRPC7Q9HCX4 862 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HPS4Q9NQG7 708 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SOBPA7XYQ1 873 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TADA3O75528 432 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FNTBP49356 437 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DMWDQ09019 674 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RUNX3Q13761 415 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CNNM4Q6P4Q7 775 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C7orf25Q9BPX7 421 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP18Q9UMW8 372 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ATP2C2O75185 946 aa30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DLATP10515 647 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C4orf50Q6ZRC1 276 aa30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NELFCDQ8IXH7 590 aa30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SYNPOQ8N3V7 929 aa30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TTC16Q8NEE8 873 aa30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RIN3Q8TB24 985 aa30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SNX21Q969T3 373 aa30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MYRFLQ96LU7 910 aa30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MMS19Q96T76 1030 aa30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CDH9Q9ULB4 789 aa30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 K7ESF4 209 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CLIC2O15247 247 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LMO2P25791 158 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CYP2J2P51589 502 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM171BQ6P995 826 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UNC13DQ70J99 1090 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FNBP1Q96RU3 617 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BLZF1Q9H2G9 400 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAGEF1Q9HAY2 307 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C2orf42Q9NWW7 574 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DLL3Q9NYJ7 618 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UBE4BO95155 1302 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TGFB1I1O43294 461 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PDGFRBP09619 1106 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARSAP15289 507 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TNNI1P19237 187 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CASP1P29466 404 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAGEA11P43364 429 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LAIR1Q6GTX8 287 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LIMS2Q7Z4I7 341 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LONP2Q86WA8 852 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HSCBQ8IWL3 235 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MYLPFQ96A32 169 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CKMP06732 381 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WARSP23381 471 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM160A1Q05DH4 1040 aa30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms