RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566915.5

LPCAT2-208, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, human

TSL 1 (best)

Gene LPCAT2, Length 5,285 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPCAT2-208	ENST00000566915	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	USP6NL	Q92738	828 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	LRRC39	Q96DD0	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	CAPNS2	Q96L46	248 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	NCAM2	O15394	837 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	SORBS3	O60504	671 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	NMT2	O60551	498 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	KIT	P10721	976 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	AKR1B1	P15121	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	C4BPB	P20851	252 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	PRKCI	P41743	596 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	CDK7	P50613	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	NTRK3	Q16288	839 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	HORMAD1	Q86X24	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	FAM151A	Q8WW52	585 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	DLG3	Q92796	817 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	CATSPER2	Q96P56	530 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	TBCB	Q99426	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	SH3GL1	Q99961	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915		E5RI56	91 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915		M0R3G1	203 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	KLHL41	O60662	606 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	PROSC	O94903	275 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	PRKCB	P05771	671 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	APRT	P07741	180 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	SPDYE6	P0CI01	402 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	RALA	P11233	206 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	SERPINB1	P30740	379 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	HK2	P52789	917 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	TPI1	P60174	286 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	GSTA3	Q16772	222 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	EHD4	Q9H223	541 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	SP110	Q9HB58	689 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	NHS	Q6T4R5	1651 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZBBX	A8MT70	800 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	ABL1	P00519	1130 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	F9	P00740	461 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	HOXC6	P09630	235 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	ALAD	P13716	330 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LPCAT2-208	ENST00000566915	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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