RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566622.5

RPL4-212, Transcript of ribosomal protein L4, humanhuman

TSL 2

Gene RPL4, Length 817 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4-212ENST00000566622 RUNX3Q13761 415 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 MON1AQ86VX9 555 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 GPD1LQ8N335 351 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 TDP1Q9NUW8 608 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 INTS13Q9NVM9 706 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4-212ENST00000566622 C2orf78A6NCI8 922 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 TGFB1I1O43294 461 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 HUS1O60921 280 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 AVPR1AP37288 418 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 TXLNAP40222 546 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 USP46P62068 366 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 PLCB2Q00722 1185 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 TSPY1Q01534 308 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 TAF12Q16514 161 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 FAM171BQ6P995 826 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 SHC4Q6S5L8 630 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 LONP2Q86WA8 852 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 MYRFLQ96LU7 910 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 GCNAQ96QF7 691 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 TRIM9Q9C026 710 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 ABCB6Q9NP58 842 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 GCNT4Q9P109 453 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 STX6O43752 255 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 CSH1P0DML2 217 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 CSH2P0DML3 217 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 CACNA2D1P54289 1103 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 RBP5P82980 135 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 LMNB2Q03252 620 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 USP4Q13107 963 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 PPP2R5DQ14738 602 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 ZNF77Q15935 545 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 CCDC6Q16204 474 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 MYLPFQ96A32 169 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.63□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 RNF40O75150 1001 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 RETP07949 1114 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.071e-13■□□□□ 9.2
RPL4-212ENST00000566622 HOXA6P31267 233 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 GJA4P35212 333 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 GALK1P51570 392 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 MYL7Q01449 175 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 EHHADHQ08426 723 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 ALCAMQ13740 583 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 GAB4Q2WGN9 574 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 TTC16Q8NEE8 873 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 ZNF516Q92618 1163 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 HPDLQ96IR7 371 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 SYT15Q9BQS2 421 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 SPTLC2O15270 562 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 PDGFRBP09619 1106 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 BDNFP23560 247 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RPL4-212ENST00000566622 MTF1Q14872 753 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms