RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548557.1

CASC18-202, Transcript of cancer susceptibility 18, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC18, Length 2,503 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC18-202ENST00000548557 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 ZNF623O75123 536 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 TIMP1P01033 207 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 CXCL10P02778 98 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 ACOT2P49753 483 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 VAMP7P51809 220 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 CYP24A1Q07973 514 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 PSMD6Q15008 389 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 RASSF3Q86WH2 238 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 CD302Q8IX05 232 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 HACE1Q8IYU2 909 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 SEPT8Q92599 483 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 CAVIN3Q969G5 261 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 ABHD8Q96I13 439 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 ACAP3Q96P50 834 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 SH3GL2Q99962 352 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 ASB7Q9H672 318 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 GDF3Q9NR23 364 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 ZNF69Q9UC07 566 aa6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 A0A0U1RQF3 1178 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 PMM2O15305 246 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 SGTAO43765 313 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 NBNO60934 754 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 IL18RAPO95256 599 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 NPTXRO95502 500 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 FTCDO95954 541 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 ADRB2P07550 413 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 STAG3L1P0CL83 205 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 ACTN1P12814 892 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 EPB42P16452 691 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 SLC9A1P19634 815 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 GTF2H1P32780 548 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 AP3M2P53677 418 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 CLDN10P78369 228 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 ARID5AQ03989 594 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 DSC3Q14574 896 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 UBXN11Q5T124 520 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 SRLQ86TD4 932 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 OR8H2Q8N162 312 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 SLC35C1Q96A29 364 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 FNBP1Q96RU3 617 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 NACA2Q9H009 215 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 PARP2Q9UGN5 583 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 P4HA2O15460 535 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 PIP5K1CO60331 668 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 GLI1P08151 1106 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 PFKMP08237 780 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 UCHL3P15374 230 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 RAG1P15918 1043 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 PON1P27169 355 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 PRKCIP41743 596 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 COPAP53621 1224 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 PTK2Q05397 1052 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 NNTQ13423 1086 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 GPNMBQ14956 572 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 CFAP58Q5T655 872 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 ALS2CLQ60I27 953 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 TMEM199Q8N511 208 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.95□□□□□ -1.3
CASC18-202ENST00000548557 ADAM2Q99965 735 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms