RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548092.5

TRAFD1-204, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAFD1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-204ENST00000548092 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FNDC7Q5VTL7 733 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SGMS1Q86VZ5 419 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PDCL2Q8N4E4 241 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM105Q8N8V8 129 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CHST14Q8NCH0 376 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 IL17RAQ96F46 866 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MAML3Q96JK9 1138 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 C16orf92Q96LL3 132 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 GPHA2Q96T91 129 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CSRNP2Q9H175 543 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 NELFAQ9H3P2 528 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 DOCK1Q14185 1865 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 A0A1B0GUL6 1792 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 PMS2P1A4D2B8 440 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 KRT38O76015 456 aa4.83□□□□□ -1.64
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TRAFD1-204ENST00000548092 PROS1P07225 676 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 TRIM27P14373 513 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC9A1P19634 815 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 ACRV1P26436 265 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 CYP2C18P33260 490 aa4.83□□□□□ -1.64
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TRAFD1-204ENST00000548092 CBX1P83916 185 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 DCTN1Q14203 1278 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 CREB3L3Q68CJ9 461 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 KLHDC10Q6PID8 442 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 USP51Q70EK9 711 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 MORC1Q86VD1 984 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 CHD1LQ86WJ1 897 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 D2HGDHQ8N465 521 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 RABGGTAQ92696 567 aa4.83□□□□□ -1.64
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TRAFD1-204ENST00000548092 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 PHACTR3Q96KR7 559 aa4.83□□□□□ -1.64
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TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 TMOD2Q9NZR1 351 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 VWA7Q9Y334 891 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 FBN3Q75N90 2809 aa4.82□□□□□ -1.64
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TRAFD1-204ENST00000548092 B4E1Z4 1266 aa4.82□□□□□ -1.64
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TRAFD1-204ENST00000548092 KCNG4Q8TDN1 519 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM151AQ8WW52 585 aa4.82□□□□□ -1.64
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TRAFD1-204ENST00000548092 TSPY26PQ9H489 355 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 STARD7Q9NQZ5 370 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 ACSS2Q9NR19 701 aa4.82□□□□□ -1.64
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TRAFD1-204ENST00000548092 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 B4GALT6Q9UBX8 382 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 CTNNA3Q9UI47 895 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 DENND2AQ9ULE3 1009 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 ZFHX3Q15911 3703 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 FBN2P35556 2912 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 UMODL1Q5DID0 1318 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 SYCE3A1L190 88 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 CAPN14A8MX76 684 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 LOC730098B7Z3J9 87 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 SNAP23O00161 211 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 CBX4O00257 560 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 MBTPS2O43462 519 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 PDE8AO60658 829 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF202O95125 648 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAFD1-204ENST00000548092 JMJD7P0C870 316 aa4.81□□□□□ -1.64
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