RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	UROC1	Q96N76	676 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	TIMP4	Q99727	224 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	EHD3	Q9NZN3	535 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	DKK3	Q9UBP4	350 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	CFAP69	A5D8W1	941 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	IGLV2-14	P01704	120 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	HRG	P04196	525 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	NR2F6	P10588	404 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	3.78	□□□□□ -1.8	4e-12	■□□□□ 9.3
MDM2-233	ENST00000545204	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ITPKB	P27987	946 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SP2	Q02086	613 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SLC13A2	Q13183	592 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	CTBP1	Q13363	440 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	BMPR2	Q13873	1038 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	GRM3	Q14832	879 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF575	Q86XF7	245 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	TTC8	Q8TAM2	541 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	MAML1	Q92585	1016 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	ASB6	Q9NWX5	421 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	STK32B	Q9NY57	414 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-233	ENST00000545204	USP19	O94966	1318 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	TPP1	O14773	563 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	MARCH6	O60337	910 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	TLR5	O60602	858 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	NXPH3	O95157	252 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	TTLL1	O95922	423 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ZBED1	O96006	694 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	LRPAP1	P30533	357 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	CACNB3	P54284	484 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	SATB1	Q01826	763 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	MYO1E	Q12965	1108 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	RAB32	Q13637	225 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	GALE	Q14376	348 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	C14orf80	Q86SX3	495 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	NELL1	Q92832	810 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	SARAF	Q96BY9	339 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	SUCLG2	Q96I99	432 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	OBP2A	Q9NY56	170 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ISM1	B1AKI9	464 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM233	B4DJY2	109 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	TBC1D4	O60343	1298 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	PROP1	O75360	226 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	ERBB2	P04626	1255 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	CSF1R	P07333	972 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MDM2-233	ENST00000545204	EBLN1	P0CF75	366 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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