RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 CSH2P0DML3 217 aa23.4■■□□□ 1.34
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PTPRK-222ENST00000532751 FMO5P49326 533 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 DPCR1Q3MIW9 517 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 VSTM1Q6UX27 236 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 MTSS1LQ765P7 747 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 TCEAL4Q96EI5 215 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 MCRS1Q96EZ8 462 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRK-222ENST00000532751 MYH10P35580 1976 aa23.4■■□□□ 1.34
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PTPRK-222ENST00000532751 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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PTPRK-222ENST00000532751 GCNAQ96QF7 691 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC3Q9BY71 257 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRK-222ENST00000532751 GPR88Q9GZN0 384 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRK-222ENST00000532751 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
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PTPRK-222ENST00000532751 TDGQ13569 410 aa23.38■■□□□ 1.33
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PTPRK-222ENST00000532751 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.38■■□□□ 1.33
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PTPRK-222ENST00000532751 KCNH2Q12809 1159 aa23.37■■□□□ 1.33
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PTPRK-222ENST00000532751 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.37■■□□□ 1.33
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PTPRK-222ENST00000532751 MED15Q96RN5 788 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRK-222ENST00000532751 B3GNT5Q9BYG0 378 aa23.36■■□□□ 1.33
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PTPRK-222ENST00000532751 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.36■■□□□ 1.33
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PTPRK-222ENST00000532751 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
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PTPRK-222ENST00000532751 SLC44A3Q8N4M1 653 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRK-222ENST00000532751 C8orf48Q96LL4 319 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRK-222ENST00000532751 NT5C1BQ96P26 610 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRK-222ENST00000532751 IL21Q9HBE4 155 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRK-222ENST00000532751 ZMYM5Q9UJ78 669 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRK-222ENST00000532751 DUSP12Q9UNI6 340 aa23.34■■□□□ 1.33
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