RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532321.1

CKAP5-211, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 4

Gene CKAP5, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-211ENST00000532321 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 PLA2G5P39877 138 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 CETN2P41208 172 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 ASPAP45381 313 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 RAB27AP51159 221 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 NOMO3P69849 1222 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 TMEM62Q0P6H9 643 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 PTK7Q13308 1070 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 CNGA2Q16280 664 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 KCNA10Q16322 511 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 DBN1Q16643 649 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 FAM47CQ5HY64 1035 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 FAM26DQ5JW98 314 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 WDR93Q6P2C0 686 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 TMCO3Q6UWJ1 677 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 CXCL17Q6UXB2 119 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 DPH6Q7L8W6 267 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 UNC93AQ86WB7 457 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 TMEM192Q8IY95 271 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 RASGEF1CQ8N431 466 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 SPATA4Q8NEY3 305 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 MAIP1Q8WWC4 291 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 ARHGEF26Q96DR7 871 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 TMEM176AQ96HP8 235 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 CAPZA3Q96KX2 299 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF560Q96MR9 790 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 RUNDC3BQ96NL0 473 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 PPP1R16BQ96T49 567 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 NUP85Q9BW27 656 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 TRAIPQ9BWF2 469 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 PARD6BQ9BYG5 372 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 ARFGAP3Q9NP61 516 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 UBN1Q9NPG3 1134 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.56e-7■■■■■ 143
CKAP5-211ENST00000532321 SLC38A7Q9NVC3 462 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 PARVAQ9NVD7 372 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 SNTG2Q9NY99 539 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 TAS2R14Q9NYV8 317 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 ADAM22Q9P0K1 906 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 PARP2Q9UGN5 583 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 SIX4Q9UIU6 781 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 RAB21Q9UL25 225 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 DYRK1BQ9Y463 629 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 CDY2AQ9Y6F7 541 aa5.65□□□□□ -1.5
CKAP5-211ENST00000532321 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 ARHGEF37A1IGU5 675 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 MYADML2A6NDP7 307 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF185O15231 689 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 NCK2O43639 380 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 SPOPO43791 374 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF623O75123 536 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 CILPO75339 1184 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 WEE2P0C1S8 567 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 SETSIPP0DME0 302 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 ITGA4P13612 1032 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 CD19P15391 556 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 CD58P19256 250 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 FGFR4P22455 802 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 MMP8P22894 467 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 MAN1A1P33908 653 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 IRS1P35568 1242 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 RWDD2BP57060 319 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 INCA1Q0VD86 236 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 PTP4A2Q12974 167 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 ITGA7Q13683 1181 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 MESDQ14696 234 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 PTGISQ16647 500 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 SV2CQ496J9 727 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 SGO2Q562F6 1265 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 UBXN11Q5T124 520 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 SEL1L2Q5TEA6 688 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 NAA35Q5VZE5 725 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 MON1BQ7L1V2 547 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 MAATS1Q7Z4T9 603 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 FAM228AQ86W67 206 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 ERICH1Q86X53 443 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 PALB2Q86YC2 1186 aa5.64□□□□□ -1.51
CKAP5-211ENST00000532321 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms