RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 SYNPOQ8N3V7 929 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 GLIS3Q8NEA6 775 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 HPS3Q969F9 1004 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 USP28Q96RU2 1077 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC22A12Q96S37 553 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 PKMYT1Q99640 499 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 AXIN1O15169 862 aa25.8■■□□□ 1.72
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PTPRJ-205ENST00000527952 CNR2P34972 360 aa25.8■■□□□ 1.72
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PTPRJ-205ENST00000527952 SCN4BQ8IWT1 228 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 ADGRF2Q8IZF7 708 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 OLFML3Q9NRN5 406 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRJ-205ENST00000527952 SPAG17Q6Q759 2223 aa25.8■■□□□ 1.72
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PTPRJ-205ENST00000527952 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
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PTPRJ-205ENST00000527952 ITGA11Q9UKX5 1188 aa25.79■■□□□ 1.72
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PTPRJ-205ENST00000527952 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
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PTPRJ-205ENST00000527952 ZMYM5Q9UJ78 669 aa25.78■■□□□ 1.72
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PTPRJ-205ENST00000527952 KCNA4P22459 653 aa25.77■■□□□ 1.72
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PTPRJ-205ENST00000527952 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa25.77■■□□□ 1.72
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PTPRJ-205ENST00000527952 SLC30A4O14863 429 aa25.76■■□□□ 1.71
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PTPRJ-205ENST00000527952 SLC39A14Q15043 492 aa25.76■■□□□ 1.71
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PTPRJ-205ENST00000527952 TOP6BLQ8N6T0 577 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 HHIPQ96QV1 700 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 ABCB6Q9NP58 842 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 INTS13Q9NVM9 706 aa25.76■■□□□ 1.71
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PTPRJ-205ENST00000527952 C2orf78A6NCI8 922 aa25.75■■□□□ 1.71
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PTPRJ-205ENST00000527952 GAB3Q8WWW8 586 aa25.75■■□□□ 1.71
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PTPRJ-205ENST00000527952 P2RY13Q9BPV8 354 aa25.75■■□□□ 1.71
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PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM206Q9H813 350 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 ECT2Q9H8V3 914 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.74■■□□□ 1.71
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PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 MYLPFQ96A32 169 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 MYRFLQ96LU7 910 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 LINC00597Q9H2U6 94 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 SMOC1Q9H4F8 434 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-205ENST00000527952 CRTAC1Q9NQ79 661 aa25.74■■□□□ 1.71
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