RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 GLOD4Q9HC38 313 aa6.2□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 DCLK1O15075 740 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 FESP07332 822 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 MMP13P45452 471 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 MAP2K6P52564 334 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PDE1AP54750 535 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 CYP4F2P78329 520 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 GTF2H3Q13889 308 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 IQCB1Q15051 598 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PNPOQ9NVS9 261 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.19□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa6.18□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PPEF2O14830 753 aa6.18□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 LILRA4P59901 499 aa6.18□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 EMC10Q5UCC4 262 aa6.18□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.18□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 GALNT16Q8N428 558 aa6.18□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.18□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 ASB2Q96Q27 587 aa6.18□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.18□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 ADAMTS3O15072 1205 aa6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 SP2Q02086 613 aa6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PGS1Q32NB8 556 aa6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 CCDC157Q569K6 752 aa6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 CHSY1Q86X52 802 aa6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 GLG1Q92896 1179 aa6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 H3BUI4 141 aa6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PLCD1P51178 756 aa6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 TPTEP56180 551 aa6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 E2F2Q14209 437 aa6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 CNGA4Q8IV77 575 aa6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 R3HDM4Q96D70 268 aa6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 C5orf34Q96MH7 638 aa6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 VPS16Q9H269 839 aa6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.16□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 SCRIBQ14160 1630 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 A1L4Q6 167 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 H7C1Q1 480 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 UNC5CO95185 931 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 POU2F2P09086 479 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 VIPR2P41587 438 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 ARHGAP25P42331 645 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 SOX8P57073 446 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 EVA1CP58658 441 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 AMPD3Q01432 767 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 SATB1Q01826 763 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 TMEM240Q5SV17 173 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZWC4 215 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 SLC35A4Q96G79 324 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.15□□□□□ -1.42
SGCE-211ENST00000522045 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.15□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 TJP3O95049 919 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 GRPP07492 148 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 HDCP19113 662 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 KCNJ5P48544 419 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 GPSM2P81274 684 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 LAMB3Q13751 1172 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 PLS1Q14651 629 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.14□□□□□ -1.43
SGCE-211ENST00000522045 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
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