RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 AVPR1AP37288 418 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 GPR153Q6NV75 609 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM270Q6UE05 265 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 DRC7Q8IY82 874 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SPAG5Q96R06 1193 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 FIZ1Q96SL8 496 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 DSC1Q08554 894 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MORC3Q14149 939 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ANO6Q4KMQ2 910 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 KRT39Q6A163 491 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 EFHBQ8N7U6 833 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 NT5C1BQ96P26 610 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 CNTN3Q9P232 1028 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 L1RE1Q9UN81 338 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 C2CD2Q9Y426 696 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 ALPK3Q96L96 1907 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 PIEZO1Q92508 2521 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3P1-201ENST00000514813 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNE1P15382 129 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CD72P21854 359 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 FSHRP23945 695 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNB1Q14721 858 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 DUSP6Q16828 381 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ARSIQ5FYB1 569 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 WDR49Q8IV35 697 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CGRRF1Q99675 332 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 POMKQ9H5K3 350 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 WDR27A2RRH5 827 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 F8VP50 259 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 GPR15P49685 360 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF165P49910 485 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 DSG1Q02413 1049 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 TAF3Q5VWG9 929 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 PDCL2Q8N4E4 241 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 C12orf29Q8N999 325 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 GPT2Q8TD30 523 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 KXD1Q9BQD3 176 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CALCAP01258 141 aa6.95□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 HOXD13P35453 343 aa6.95□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 RGS7P49802 495 aa6.95□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 MAP3K7CLP57077 242 aa6.95□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP4F8P98187 520 aa6.95□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ADAM15Q13444 863 aa6.95□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 GRM2Q14416 872 aa6.95□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 TBCELQ5QJ74 424 aa6.95□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.95□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.95□□□□□ -1.3
RRN3P1-201ENST00000514813 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms