RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 CCDC63Q8NA47 563 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ASTN1O14525 1302 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 QSOX1O00391 747 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 KIF3CO14782 793 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CCDC22O60826 627 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 AMHP03971 560 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 NR1D1P20393 614 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 NPY2RP49146 381 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 SLC11A2P49281 568 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 GPR142Q7Z601 462 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 GPR20Q99678 358 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ZNF670Q9BS34 389 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 DNA2P51530 1060 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CENPTQ96BT3 561 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CNGB3Q9NQW8 809 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ALG6Q9Y672 507 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.437e-6■■■■■ 33.4
POLK-215ENST00000514141 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 SOBPA7XYQ1 873 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 INSRRP14616 1297 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CLCN6P51797 869 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 PPP2R2AP63151 447 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 HIF1AQ16665 826 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 USP49Q70CQ1 688 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 SLCO2A1Q92959 643 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 STMN2Q93045 179 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 SAMD11Q96NU1 681 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FOXN1O15353 648 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CYP26A1O43174 497 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 TIMM44O43615 452 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 DAB1O75553 588 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CRCPO75575 148 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 MLNP12872 115 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 TPI1P60174 286 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 GRIN1Q05586 938 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 GRB14Q14449 540 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 GNASQ5JWF2 1037 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ZNF398Q8TD17 642 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 FZD8Q9H461 694 aa6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
POLK-215ENST00000514141 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms