RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 PTPRJQ12913 1337 aa18.16■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 ZNF233A6NK53 670 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 SOBPA7XYQ1 873 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 GABRDO14764 452 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 SPTLC2O15270 562 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 TADA3O75528 432 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 NOL4O94818 638 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 PCSK1P29120 753 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 HOXD13P35453 343 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 LMNB2Q03252 620 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 SPEM2Q0P670 501 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 MYO1EQ12965 1108 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 E2F4Q16254 413 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 RIN3Q8TB24 985 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 HPDLQ96IR7 371 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 LRRC27Q9C0I9 530 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 KIF9Q9HAQ2 790 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 KBTBD4Q9NVX7 518 aa18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
HERC3-211ENST00000513325 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
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HERC3-211ENST00000513325 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 ATP2C2O75185 946 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 ARSAP15289 507 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP8P85298 464 aa18.14■□□□□ 0.49
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HERC3-211ENST00000513325 CFAP221Q4G0U5 840 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 SCN4BQ8IWT1 228 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 CHFRQ96EP1 664 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 MYRFLQ96LU7 910 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 TRIM9Q9C026 710 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 TRPC7Q9HCX4 862 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 HSPBP1Q9NZL4 362 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 CEP250Q9BV73 2442 aa18.14■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 DENND4CQ5VZ89 1909 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 PPP6R2O75170 966 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 TNNC2P02585 160 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 RETP07949 1114 aa18.13■□□□□ 0.49
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HERC3-211ENST00000513325 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 DUOXA2Q1HG44 320 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 TMEM196Q5HYL7 178 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 FSTL4Q6MZW2 842 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 PKN3Q6P5Z2 889 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 FAM171BQ6P995 826 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 DPH6Q7L8W6 267 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 DHX58Q96C10 678 aa18.13■□□□□ 0.49
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A12Q96S37 553 aa18.13■□□□□ 0.49
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HERC3-211ENST00000513325 SYT15Q9BQS2 421 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 BACH2Q9BYV9 841 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 CUEDC2Q9H467 287 aa18.13■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
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HERC3-211ENST00000513325 HOXA6P31267 233 aa18.12■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 AMPD3Q01432 767 aa18.12■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 FAM160A1Q05DH4 1040 aa18.12■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 SHC4Q6S5L8 630 aa18.12■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 LIMS2Q7Z4I7 341 aa18.12■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 WDR49Q8IV35 697 aa18.12■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 TTC16Q8NEE8 873 aa18.12■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1586Q9HCI6 787 aa18.12■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 CRTAC1Q9NQ79 661 aa18.12■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 TGFB1I1O43294 461 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 CKMP06732 381 aa18.11■□□□□ 0.49
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HERC3-211ENST00000513325 USP17L7P0C7H9 530 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 MAGEA11P43364 429 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 AMPD2Q01433 879 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 MTF1Q14872 753 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 PDGFRLQ15198 375 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 FAM26FQ5R3K3 315 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 C4orf50Q6ZRC1 276 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 CEP68Q76N32 757 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 WDR5BQ86VZ2 330 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 IQUBQ8NA54 791 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 RDH13Q8NBN7 331 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 ZNF507Q8TCN5 953 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 MYLPFQ96A32 169 aa18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
HERC3-211ENST00000513325 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
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