RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503506.6

TXNRD1-205, Transcript of thioredoxin reductase 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TXNRD1, Length 3,930 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1-205ENST00000503506 BTBD7Q9P203 1132 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 GSC2O15499 205 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 PTGIRP43119 386 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 PPP3CAQ08209 521 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 NCOA4Q13772 614 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 Q4G0T1 1027 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 FAXCQ5TGI0 409 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 PLA2G4FQ68DD2 849 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 VSTM1Q6UX27 236 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 SV2AQ7L0J3 742 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 PALB2Q86YC2 1186 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 CDHR1Q96JP9 859 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ECSITQ9BQ95 431 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ING2Q9H160 280 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 APPL1Q9UKG1 709 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 CDY1Q9Y6F8 540 aa7.2□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 PEX11AO75192 247 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 PGM3O95394 542 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 SDC4P31431 198 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ADARP55265 1226 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ITPK1Q13572 414 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.266e-11■■■■□ 24.6
TXNRD1-205ENST00000503506 ADRM1Q16186 407 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ANO7Q6IWH7 933 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 TRIM15Q9C019 465 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ATXN10Q9UBB4 475 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 COG5Q9UP83 839 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 MROH7Q68CQ1 1323 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 NFAT5O94916 1531 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 FAM86B1E9PN63 330 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 M0QYV0 167 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 EML1O00423 815 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 DGKIO75912 1065 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 PIAS1O75925 651 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 FAM86B2P0C5J1 330 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 PSMC3P17980 439 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 GTF2H1P32780 548 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ELK3P41970 407 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 GRIK3Q13003 919 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 BMPR2Q13873 1038 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 PRPSAP1Q14558 356 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ARSHQ5FYA8 562 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 PRUNE1Q86TP1 453 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 FAM228AQ86W67 206 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 LDHDQ86WU2 507 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 CCNJLQ8IV13 435 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 C7orf31Q8N865 590 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 RNF169Q8NCN4 708 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 GCNAQ96QF7 691 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 RSAD1Q9HA92 442 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 TBX20Q9UMR3 447 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ROBO3Q96MS0 1386 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 FRMPD4Q14CM0 1322 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 ZBBXA8MT70 800 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 APOL1O14791 398 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 TGFB1I1O43294 461 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 CYP1A2P05177 515 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 LYNP07948 512 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 RAG1P15918 1043 aa7.19□□□□□ -1.26
TXNRD1-205ENST00000503506 CCND2P30279 289 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms