RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495491.5

HCLS1-211, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,219 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-211	ENST00000495491	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	PDGFRL	Q15198	375 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	STK38	Q15208	465 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TAF12	Q16514	161 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	LONP2	Q86WA8	852 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	GIPC2	Q8TF65	315 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	NCDN	Q9UBB6	729 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CDH9	Q9ULB4	789 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TACC1	O75410	805 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TADA3	O75528	432 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	RUNX3	Q13761	415 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CHFR	Q96EP1	664 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	HPDL	Q96IR7	371 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	HPS4	Q9NQG7	708 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	GKN1	Q9NS71	199 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	GCNT4	Q9P109	453 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	PTPRJ	Q12913	1337 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	ATG13	O75143	517 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	AKAP3	O75969	853 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TNNC2	P02585	160 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CYP2F1	P24903	491 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SOX9	P48436	509 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	PPP3CC	P48454	512 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	PDE6C	P51160	858 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TNK2	Q07912	1038 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	BFSP1	Q12934	665 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	PSMD6	Q15008	389 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	FBXO43	Q4G163	708 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	EXOC4	Q96A65	974 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	HINFP	Q9BQA5	517 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	EHD2	Q9NZN4	543 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CCL26	Q9Y258	94 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	HR	O43593	1189 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	DRD1	P21728	446 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CLDN10	P78369	228 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	USP4	Q13107	963 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	ZNF77	Q15935	545 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491		Q6ZS52	159 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	PDILT	Q8N807	584 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	LOXL4	Q96JB6	756 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	KRT19	P08727	400 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	ATIC	P31939	592 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	GPR15	P49685	360 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-211	ENST00000495491	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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