RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493208.1

IRF1-210, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IRF1, Length 1,023 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-210ENST00000493208 SIX4Q9UIU6 781 aa14.53□□□□□ -0.08
IRF1-210ENST00000493208 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.53□□□□□ -0.08
IRF1-210ENST00000493208 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 A8MXQ7 604 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 IKBKBO14920 756 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 MAPK13O15264 365 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 STX10O60499 249 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 MOSPD3O75425 235 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 SOAT2O75908 522 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 NOL4O94818 638 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 SMC2O95347 1197 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 NR3C1P04150 777 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 USP17L7P0C7H9 530 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 CCR3P51677 355 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 NLRP12P59046 1061 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 ENPEPQ07075 957 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 KCNB1Q14721 858 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 CEP135Q66GS9 1140 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 GAREM2Q75VX8 874 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 CLDN23Q96B33 292 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 SPATA17Q96L03 361 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 MYRFLQ96LU7 910 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 TDP1Q9NUW8 608 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 HPSEQ9Y251 543 aa14.52□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 RHOBTB3O94955 611 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 CKMP06732 381 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 CYP2F1P24903 491 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 HOXD13P35453 343 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 STK4Q13043 487 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 NR1H3Q13133 447 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 NCOA4Q13772 614 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 PDGFRLQ15198 375 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 FAM171BQ6P995 826 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 MON1AQ86VX9 555 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 TMEM130Q8N3G9 435 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 STKLD1Q8NE28 680 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 TMC2Q8TDI7 906 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 TSG101Q99816 390 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 HINFPQ9BQA5 517 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.51□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 PRR23AA6NEV1 266 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 SP9P0CG40 484 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 CASP1P29466 404 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 PPP1R2P41236 205 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 NDUFA8P51970 172 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 WNT7BP56706 349 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 CYP4F8P98187 520 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 STIM1Q13586 685 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 NFIL3Q16649 462 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 DDR2Q16832 855 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 TTC39CQ8N584 583 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 CXorf38Q8TB03 319 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 MYLPFQ96A32 169 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 RAB23Q9ULC3 237 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 TCHHQ07283 1943 aa14.5□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 ANK1P16157 1881 aa14.49□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.49□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 KLRC4O43908 158 aa14.49□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 ATG13O75143 517 aa14.49□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 ZNF202O95125 648 aa14.49□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 PDGFRBP09619 1106 aa14.49□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 CD72P21854 359 aa14.49□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 NR2F2P24468 414 aa14.49□□□□□ -0.09
IRF1-210ENST00000493208 CCNE1P24864 410 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms