RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 SPRED2Q7Z698 418 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CREG2Q8IUH2 290 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 FANCLQ9NW38 375 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC16A4O15374 487 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 SMC2O95347 1197 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CPP00450 1065 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 MYL1P05976 194 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ASGR1P07306 291 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CD3EP07766 207 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC192P0DO97 292 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 RARBP10826 455 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ATP1A3P13637 1013 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 PLS3P13797 630 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF18P17022 549 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CD96P40200 585 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 NPTX2P47972 431 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 NCKAP1LP55160 1127 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 IGBP1P78318 339 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 EGR3Q06889 387 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM209AQ5JX71 171 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CENPPQ6IPU0 288 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 MLKLQ8NB16 471 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF333Q96JL9 665 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 IER2Q9BTL4 223 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 AZI2Q9H6S1 392 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 EXOC1Q9NV70 894 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ANO10Q9NW15 660 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ABLIM1O14639 778 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 PRODHO43272 600 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 GPR32O75388 356 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 VTNP04004 478 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ADSSP30520 456 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC26A2P50443 739 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ACLYP53396 1101 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 PEX3P56589 373 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 GTF2BQ00403 316 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 AMPD3Q01432 767 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 PPFIA1Q13136 1202 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 GPNMBQ14956 572 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ODR4Q5SWX8 454 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-212ENST00000491266 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
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