RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM8AQ9HCN3 771 aa28.62■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 TECTAO75443 2155 aa28.62■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 HCRTO43612 131 aa28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 BDNFP23560 247 aa28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 CCNE1P24864 410 aa28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 AVPR2P30518 371 aa28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 MAGEA11P43364 429 aa28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 ANKRD40Q6AI12 368 aa28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 MED10Q9BTT4 135 aa28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 LRRC3Q9BY71 257 aa28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 BRD9Q9H8M2 597 aa28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGEF3Q9NR81 526 aa28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 TSC2P49815 1807 aa28.61■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 BIN1O00499 593 aa28.6■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 TRIM66O15016 1216 aa28.6■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 VNN1O95497 513 aa28.6■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 CLCN5P51795 746 aa28.6■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 WDR44Q5JSH3 913 aa28.6■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa28.6■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa28.6■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 ZSWIM3Q96MP5 696 aa28.6■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 PKMYT1Q99640 499 aa28.6■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 TASP1Q9H6P5 420 aa28.6■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 SMYD3Q9H7B4 428 aa28.6■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa28.6■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 DOCK6Q96HP0 2047 aa28.6■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 MOSPD3O75425 235 aa28.59■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 PSMC3P17980 439 aa28.59■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 GPR15P49685 360 aa28.59■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC40Q4G0X9 1142 aa28.59■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 SDHAF4Q5VUM1 108 aa28.59■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 GAREM2Q75VX8 874 aa28.59■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 IRF7Q92985 503 aa28.59■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 PCED1BQ96HM7 432 aa28.59■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 CEP295NLQ96MC4 621 aa28.59■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 ELOVL4Q9GZR5 314 aa28.59■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 CRTAC1Q9NQ79 661 aa28.59■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 DOCK8Q8NF50 2099 aa28.58■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC38A8A6NNN8 435 aa28.58■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF263O14978 683 aa28.58■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 ASS1P00966 412 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 AVPR1AP37288 418 aa28.58■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 MXI1P50539 228 aa28.58■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 CDH8P55286 799 aa28.58■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 TRPV4Q9HBA0 871 aa28.58■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP28.58■■■□□ 2.17
CCZ1B-211ENST00000486840 RAP1GAPP47736 663 aa28.57■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 NUBP1P53384 320 aa28.57■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 CYP4F8P98187 520 aa28.57■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 PPP3CAQ08209 521 aa28.57■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 GRM2Q14416 872 aa28.57■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 CAMK4Q16566 473 aa28.57■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC44A4Q53GD3 710 aa28.57■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 TRIML1Q8N9V2 468 aa28.57■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM122AQ96E09 287 aa28.57■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 CEP63Q96MT8 703 aa28.57■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 HEPACAM2A8MVW5 462 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 GDI1P31150 447 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 VIPR2P41587 438 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 NLRP12P59046 1061 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 NOP14P78316 857 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 PRKCQQ04759 706 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 UNC93AQ86WB7 457 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 MFSD6LQ8IWD5 586 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 FBXL13Q8NEE6 735 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 TAS1R2Q8TE23 839 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 NELFBQ8WX92 580 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 SPATA17Q96L03 361 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 GBP4Q96PP9 640 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 TBC1D17Q9HA65 648 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 CYP3A43Q9HB55 503 aa28.56■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 TRIM49BA6NDI0 452 aa28.55■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 NOL4O94818 638 aa28.55■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 CETN1Q12798 172 aa28.55■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 MORC3Q14149 939 aa28.55■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 C1orf220Q5T0J3 134 aa28.55■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa28.55■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 TTC39CQ8N584 583 aa28.55■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa28.55■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 NIF3L1Q9GZT8 377 aa28.55■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 DPEP3Q9H4B8 488 aa28.55■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 CTNND2Q9UQB3 1225 aa28.55■■■□□ 2.16
CCZ1B-211ENST00000486840 GOLGA6L22H0YM25 854 aa28.54■■■□□ 2.16
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