RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 DLATP10515 647 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SATB1Q01826 763 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 TNK2Q07912 1038 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 RUNX3Q13761 415 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SOWAHAQ2M3V2 549 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 UNC13DQ70J99 1090 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 MON1AQ86VX9 555 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 NELFCDQ8IXH7 590 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 FAM84AQ96KN4 292 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SYT15Q9BQS2 421 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CDH9Q9ULB4 789 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 GABRDO14764 452 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 NOL4O94818 638 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CLSTN1O94985 981 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 F13A1P00488 732 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 ANXA13P27216 316 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CYP2J2P51589 502 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 ATL3Q6DD88 541 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CNNM4Q6P4Q7 775 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 PRR23BQ6ZRT6 265 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 OSTM1Q86WC4 334 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 STKLD1Q8NE28 680 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 TTC16Q8NEE8 873 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CXorf38Q8TB03 319 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 SNX25Q9H3E2 840 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-212ENST00000484841 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CLIC2O15247 247 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 USP17L7P0C7H9 530 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 GRIK1P39086 918 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 TNNC1P63316 161 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CYP27A1Q02318 531 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.046e-7■□□□□ 10
ACTB-212ENST00000484841 TRPC3Q13507 836 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.045e-11■■■□□ 17.7
ACTB-212ENST00000484841 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 TMEM150AQ86TG1 271 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 XXYLT1Q8NBI6 393 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 RMDN1Q96DB5 314 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 MYRFLQ96LU7 910 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 BLZF1Q9H2G9 400 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 EBF3Q9H4W6 596 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 EHD2Q9NZN4 543 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 USP18Q9UMW8 372 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CKMP06732 381 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 SDHBP21912 280 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CNR2P34972 360 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 MAGEA11P43364 429 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 AFMP43652 599 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 PDE6CP51160 858 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 PDGFRLQ15198 375 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 MYLPFQ96A32 169 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 PKMYT1Q99640 499 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CGRRF1Q99675 332 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CCL26Q9Y258 94 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 PTPRJQ12913 1337 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CFAP54Q96N23 3096 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 HCRTO43612 131 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 ATG13O75143 517 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 PHACTR2O75167 634 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 PDGFRBP09619 1106 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 TDGF1P13385 188 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 GAS6Q14393 721 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 KCNB1Q14721 858 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 PSMD6Q15008 389 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 FAM171BQ6P995 826 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 VSTM1Q6UX27 236 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 Q6ZS52 159 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 LONP2Q86WA8 852 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 OR6B3Q8NGW1 331 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 SLC39A2Q9NP94 309 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms