RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 EVI5LQ96CN4 794 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 FAM227BQ96M60 508 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 TTPALQ9BTX7 342 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 COA1Q9GZY4 146 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CAAP1Q9H8G2 361 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SPC25Q9HBM1 224 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 DPP7Q9UHL4 492 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CLCA2Q9UQC9 943 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 AK9Q5TCS8 1911 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 MYH13Q9UKX3 1938 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0D9SFI3 127 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SHTN1A0MZ66 631 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PSMD14O00487 310 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ABHD16AO95870 558 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ENPP1P22413 925 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CHMLP26374 656 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ANAPC15P60006 121 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CDK17Q00537 523 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PURAQ00577 322 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CXCL9Q07325 125 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 FSTL1Q12841 308 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC55Q6ZSA7 311 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 MRGPREQ86SM8 312 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 KBTBD3Q8NAB2 608 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 MIGA1Q8NAN2 632 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 MDM1Q8TC05 714 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF480Q8WV37 535 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 NDC1Q9BTX1 674 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 IL25Q9H293 177 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 GPRC5DQ9NZD1 345 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 RNF181Q9P0P0 153 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 FAM205AQ6ZU69 1335 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF541Q9H0D2 1346 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF532Q9HCE3 1301 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
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PTPRC-211ENST00000484135 CTSSP25774 331 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 CCT2P78371 535 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 MECOMQ03112 1051 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 TIGD2Q4W5G0 525 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 DACT2Q5SW24 774 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 IQSEC1Q6DN90 963 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRA1Q86SQ6 560 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 WDR66Q8TBY9 1149 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF384Q8TF68 577 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 LENG9Q96B70 501 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 RAX2Q96IS3 184 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 KCNH6Q9H252 994 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 FZD1Q9UP38 647 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 SBF1O95248 1867 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-211ENST00000484135 B5MCH6 92 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 FZD9O00144 591 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 PRKAB2O43741 272 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 BRINP1O60477 761 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 DDNO94850 711 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 LAG3P18627 525 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 NR4A1P22736 598 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 ADD2P35612 726 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 TMPRSS15P98073 1019 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 PTPAQ15257 358 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 STRIP1Q5VSL9 837 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 GDF7Q7Z4P5 450 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 MLST8Q9BVC4 326 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 TMX1Q9H3N1 280 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 ARMT1Q9H993 441 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa5.57□□□□□ -1.52
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