RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 GREB1Q4ZG55 1949 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 AKAP13Q12802 2813 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 H3BQV1 296 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 GIPC1O14908 333 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 FGF19O95750 216 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 BCKDHBP21953 392 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 LONP1P36776 959 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 OPRD1P41143 372 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 LIMK1P53667 647 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CACNA2D1P54289 1103 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 USP4Q13107 963 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 MTF1Q14872 753 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ST3GAL2Q16842 350 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 SOWAHAQ2M3V2 549 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 EML3Q32P44 896 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 STPG1Q5TH74 334 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 FAM171BQ6P995 826 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 OR5B17Q8NGF7 314 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 POMGNT1Q8WZA1 660 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 MYRFLQ96LU7 910 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 PCIF1Q9H4Z3 704 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CRTAC1Q9NQ79 661 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 MYO16Q9Y6X6 1858 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 SPEGQ15772 3267 aa11.67□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CACNA1EQ15878 2313 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 K7EQS6 105 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 TBCAO75347 108 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 KRT18P05783 430 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 PAX3P23760 479 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 VEPH1Q14D04 833 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 METTL23Q86XA0 190 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 THEM5Q8N1Q8 247 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 FRMD1Q8N878 549 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ACBD6Q9BR61 282 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 MTMR12Q9C0I1 747 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 DSEQ9UL01 958 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 WASF3Q9UPY6 502 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 GON4LQ3T8J9 2241 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 TCHHQ07283 1943 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 LAMA5O15230 3695 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 PATE3B3GLJ2 98 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CSH1P0DML2 217 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 CSH2P0DML3 217 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 KCNA4P22459 653 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 AVPR1AP37288 418 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 MPLP40238 635 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 BFSP1Q12934 665 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 RESTQ13127 1097 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 SV2CQ496J9 727 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 C12orf40Q86WS4 652 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 SH3RF2Q8TEC5 729 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 WBP2Q969T9 261 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 MYLPFQ96A32 169 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 LOXL4Q96JB6 756 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 P2RY13Q9BPV8 354 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 PANK2Q9BZ23 570 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 RNF38Q9H0F5 515 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 GDAP2Q9NXN4 497 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 HCN2Q9UL51 889 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-206ENST00000474188 IL18RAPO95256 599 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 KCNK5O95279 499 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SCP2P22307 547 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SLC6A11P48066 632 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SMARCB1Q12824 385 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 DMC1Q14565 340 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms