RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 FUT10Q6P4F1 479 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 LIMS2Q7Z4I7 341 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC150Q8NCX0 1101 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 HASPINQ8TF76 798 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM169Q96HH4 297 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SUSD3Q96L08 255 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SENP8Q96LD8 212 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 CRACR2AQ9BSW2 395 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 PI4K2AQ9BTU6 479 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 VN1R3Q9BXE9 311 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 GPR62Q9BZJ7 368 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 STK39Q9UEW8 545 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 LHX6Q9UPM6 363 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 LZTS1Q9Y250 596 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 CYB561D2O14569 222 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 TEX33O43247 280 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM163BP0C2L3 166 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC9A1P19634 815 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 RFX1P22670 979 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 KCNMA1Q12791 1236 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC6Q16204 474 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SARM1Q6SZW1 724 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 DSTYKQ6XUX3 929 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 TAS1R1Q7RTX1 841 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 TOP6BLQ8N6T0 577 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 AUTS2Q8WXX7 1259 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 TATDN2Q93075 761 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 ELMO3Q96BJ8 720 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 FAXDC2Q96IV6 333 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 IMPG2Q9BZV3 1241 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.573e-13■■■■■ 167.7
SH3BP1-207ENST00000471650 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 IFNKQ9P0W0 207 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 GCNT4Q9P109 453 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 ARHGEF37A1IGU5 675 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 I3L4J1 428 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SYN3O14994 580 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 AP5Z1O43299 807 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 CBFA2T2O43439 604 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 HUS1O60921 280 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SOD2P04179 222 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 P4HA1P13674 534 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 TYMPP19971 482 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 FGFR3P22607 806 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 ASPAP45381 313 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 TNNC1P63316 161 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 LRMPQ12912 555 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SOWAHAQ2M3V2 549 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 USP41Q3LFD5 358 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 ATAT1Q5SQI0 421 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM171A1Q5VUB5 890 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 DPH6Q7L8W6 267 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC44A3Q8N4M1 653 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 APPL2Q8NEU8 664 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 NT5C1BQ96P26 610 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SIX2Q9NPC8 291 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 CHST7Q9NS84 486 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 FBXO4Q9UKT5 387 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 POLIQ9UNA4 740 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 VWA8A3KMH1 1905 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A1W2PQC6 194 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 TM4SF5O14894 197 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 TACC1O75410 805 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 CYP11A1P05108 521 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SRFP11831 508 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 ODC1P11926 461 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SPINK2P20155 84 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 TKTP29401 623 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 KLK7P49862 253 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SYCP1Q15431 976 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 WSCD1Q658N2 575 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms