RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 DPP3Q9NY33 737 aa6.34□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 GGT7Q9UJ14 662 aa6.34□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 CEP83Q9Y592 693 aa6.34□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MYH6P13533 1939 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 FSHRP23945 695 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ARL2P36404 184 aa6.33□□□□□ -1.4
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SHQ1-205ENST00000468371 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.33□□□□□ -1.4
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SHQ1-205ENST00000468371 SNX16P57768 344 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PFKPQ01813 784 aa6.32□□□□□ -1.4
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SHQ1-205ENST00000468371 TMEM139Q8IV31 216 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 STKLD1Q8NE28 680 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MBOAT7Q96N66 472 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ASB7Q9H672 318 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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