RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468254.5

CEP170-211, Transcript of centrosomal protein 170, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CEP170, Length 2,972 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170-211ENST00000468254 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 NECAB1Q8N987 351 aa3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 TMEM41AQ96HV5 264 aa3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 PDLIM2Q96JY6 352 aa3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 JAM3Q9BX67 310 aa3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 TXLNGYQ9BZA5 131 aa3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 WASH6PQ9NQA3 447 aa3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 DPP7Q9UHL4 492 aa3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 NAGPAQ9UK23 515 aa3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 KCNH4Q9UQ05 1017 aa3.79□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 KIF28PB7ZC32 967 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 PES1O00541 588 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 WNT10BO00744 389 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 ZBTB5O15062 677 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 ASNA1O43681 348 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 CYTH3O43739 400 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 MGEA5O60502 916 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 MAFKO60675 156 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 STAM2O75886 525 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 ASNSP08243 561 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 C6P13671 934 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 BRAFP15056 766 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 PSMA3P25788 255 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 GGT5P36269 586 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 RGS2P41220 211 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 NOP2P46087 812 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 MTNR1BP49286 362 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 HSD17B4P51659 736 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 TRIM29Q14134 588 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 IKBKEQ14164 716 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 NFE2L1Q14494 772 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 SEMA3AQ14563 771 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 TBCCQ15814 346 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 MAJINQ3KP22 176 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 SARM1Q6SZW1 724 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 DPP9Q86TI2 863 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 BLIDQ8IZY5 108 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 PRR18Q8N4B5 295 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 REPS2Q8NFH8 660 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 AFAP1L1Q8TED9 768 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 ZNF566Q969W8 418 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 CEP95Q96GE4 821 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 PGBD1Q96JS3 809 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 FNBP1Q96RU3 617 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 FAM129AQ9BZQ8 928 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 VCPKMTQ9H867 229 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 ZMAT4Q9H898 229 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 SP110Q9HB58 689 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 MTRRQ9UBK8 725 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 SIK3Q9Y2K2 1263 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 PIAS3Q9Y6X2 628 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 CPLX1O14810 134 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 USP1O94782 785 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 TPM2P07951 284 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 AKAP5P24588 427 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 MAOBP27338 520 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 NTF4P34130 210 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 CCR9P51686 369 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 KIF11P52732 1056 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 IRF9Q00978 393 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 AUHQ13825 339 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 PITRM1Q5JRX3 1037 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 MTFR2Q6P444 385 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 RFX8Q6ZV50 586 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 HDXQ7Z353 690 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 SCYL3Q8IZE3 742 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 ARRDC4Q8NCT1 418 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 COG8Q96MW5 612 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 TMEM237Q96Q45 408 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 MTMR9Q96QG7 549 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 ORAI3Q9BRQ5 295 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 JMJD4Q9H9V9 463 aa3.78□□□□□ -1.8
CEP170-211ENST00000468254 C6orf50Q9HD87 102 aa3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms