RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 STKLD1Q8NE28 680 aa25.6■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa25.6■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 TAF4BQ92750 862 aa25.6■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 MKNK1Q9BUB5 465 aa25.6■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 TRPV4Q9HBA0 871 aa25.6■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 IL21Q9HBE4 155 aa25.6■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 NME7Q9Y5B8 376 aa25.6■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 HLA-DRAP01903 254 aa25.59■■□□□ 1.69
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SMKR1-201ENST00000462322 P4HA1P13674 534 aa25.59■■□□□ 1.69
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SMKR1-201ENST00000462322 CYP4F8P98187 520 aa25.59■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 STIM1Q13586 685 aa25.59■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 GRM2Q14416 872 aa25.59■■□□□ 1.69
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SMKR1-201ENST00000462322 TMEM105Q8N8V8 129 aa25.59■■□□□ 1.69
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SMKR1-201ENST00000462322 MAN1B1Q9UKM7 699 aa25.59■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 KMT2EQ8IZD2 1858 aa25.59■■□□□ 1.69
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SMKR1-201ENST00000462322 BDNFP23560 247 aa25.58■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 RAP1GAPP47736 663 aa25.58■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 UBE2HP62256 183 aa25.58■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 PPP3CAQ08209 521 aa25.58■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.58■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 PCED1BQ96HM7 432 aa25.58■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 PRRX2Q99811 253 aa25.58■■□□□ 1.69
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SMKR1-201ENST00000462322 TBC1D17Q9HA65 648 aa25.58■■□□□ 1.69
SMKR1-201ENST00000462322 SLC38A8A6NNN8 435 aa25.57■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 PSMA7O14818 248 aa25.57■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 ASS1P00966 412 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 SLC44A4Q53GD3 710 aa25.57■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 VSTM1Q6UX27 236 aa25.57■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 VITQ6UXI7 678 aa25.57■■□□□ 1.68
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SMKR1-201ENST00000462322 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
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SMKR1-201ENST00000462322 SHDQ96IW2 340 aa25.57■■□□□ 1.68
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SMKR1-201ENST00000462322 TASP1Q9H6P5 420 aa25.57■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 BRD9Q9H8M2 597 aa25.57■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 HEPACAM2A8MVW5 462 aa25.56■■□□□ 1.68
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SMKR1-201ENST00000462322 F11P03951 625 aa25.56■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 PSMC3P17980 439 aa25.56■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 AOC1P19801 751 aa25.56■■□□□ 1.68
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SMKR1-201ENST00000462322 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa25.56■■□□□ 1.68
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SMKR1-201ENST00000462322 PRSS33Q8NF86 280 aa25.55■■□□□ 1.68
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SMKR1-201ENST00000462322 SPATA17Q96L03 361 aa25.54■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 MYRFLQ96LU7 910 aa25.54■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 SLC46A2Q9BY10 475 aa25.54■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 ZMYM5Q9UJ78 669 aa25.54■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM66O15016 1216 aa25.53■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 CD44P16070 742 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SMKR1-201ENST00000462322 PLA2G5P39877 138 aa25.53■■□□□ 1.68
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