RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 CXCL14O95715 111 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ICAM1P05362 532 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 CA8P35219 290 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 FNTBP49356 437 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 PDE1AP54750 535 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 EPHB3P54753 998 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 NCKAP1LP55160 1127 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 SSPNQ14714 243 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ALX1Q15699 326 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 TMEM266Q2M3C6 531 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 LETM2Q2VYF4 491 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ANKRD45Q5TZF3 282 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 VHLLQ6RSH7 139 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 PROSER1Q86XN7 944 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 OR6P1Q8NGX9 317 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 CHURC1Q8WUH1 139 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 LMBR1Q8WVP7 490 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 SHDQ96IW2 340 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 PTCHD1Q96NR3 888 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 KATNAL1Q9BW62 490 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 LTB4R2Q9NPC1 389 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 HELLSQ9NRZ9 838 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 C2orf42Q9NWW7 574 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ANAPC4Q9UJX5 808 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 RAB23Q9ULC3 237 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 RAI2Q9Y5P3 530 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 IRAK3Q9Y616 596 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 MRVI1Q9Y6F6 885 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 CDY2AQ9Y6F7 541 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 PCNX2A6NKB5 2137 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ABCA12Q86UK0 2595 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ACACAQ13085 2346 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 LAMA4Q16363 1823 aa5□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 F5P12259 2224 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 HIP1O00291 1037 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 NMT2O60551 498 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 PLA2G6O60733 806 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 CAND2O75155 1236 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 PPFIA4O75335 1185 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 LGALS2P05162 132 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 FGRP09769 529 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 MSL3P1P0C860 447 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 SCG2P13521 617 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 BMP7P18075 431 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 PI3P19957 117 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 SLC1A4P43007 532 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 TDO2P48775 406 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ERVFRD-1P60508 538 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 NUCB1Q02818 461 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 MVKQ03426 396 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ADCY1Q08828 1119 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 TMEM62Q0P6H9 643 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 HTR4Q13639 388 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 SLC44A4Q53GD3 710 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ZNF385BQ569K4 471 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 RCSD1Q6JBY9 416 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 KCNT2Q6UVM3 1135 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 PARM1Q6UWI2 310 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 FAM160B2Q86V87 743 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 CHD1LQ86WJ1 897 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 IFNL3Q8IZI9 196 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 DNAJB3Q8WWF6 145 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 CLDN23Q96B33 292 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 BORCS6Q96GS4 357 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 SPATA33Q96N06 139 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 TGIF2Q9GZN2 237 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 KLHL25Q9H0H3 589 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 NAPBQ9H115 298 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ACSL6Q9UKU0 697 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 PADI3Q9ULW8 664 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 LZTS1Q9Y250 596 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 NUMBLQ9Y6R0 609 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 MYH15Q9Y2K3 1946 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 TEX15Q9BXT5 2789 aa4.99□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 DOCK5Q9H7D0 1870 aa4.98□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 KAT6AQ92794 2004 aa4.98□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa4.98□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 FSD2A1L4K1 749 aa4.98□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 C4orf47A7E2U8 309 aa4.98□□□□□ -1.61
CNN3-204ENST00000461018 ANHXE9PGG2 379 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms