RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ODC1P11926 461 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 PDE4CQ08493 712 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 FUKQ8N0W3 1084 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 TOP1MTQ969P6 601 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 SUSD3Q96L08 255 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 MARCH5Q9NX47 278 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 CEP83Q9Y592 693 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 LTBP2Q14767 1821 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 COL4A6Q14031 1691 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 PTPRSQ13332 1948 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 OR4Q2P0C623 313 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 RFC2P35250 354 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 PDCLQ13371 301 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 MAMLD1Q13495 774 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 PKDCCQ504Y2 493 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 CEP57Q86XR8 500 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 TSC1Q92574 1164 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 SYT15Q9BQS2 421 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 TUBB4AP04350 444 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 AMPD2Q01433 879 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP8B3O60423 1300 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ALDH2P05091 517 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 GALTP07902 379 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 CACNA2D1P54289 1103 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF365Q70YC5 407 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBBXA8MT70 800 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 E5RJQ4 531 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 LHX1P48742 406 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 COG1Q8WTW3 980 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 PCED1BQ96HM7 432 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 TNIP3Q96KP6 325 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 SYNCQ9H7C4 482 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 EHD2Q9NZN4 543 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.09■■□□□ 1.13
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SH3BP2-204ENST00000452765 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 MED10Q9BTT4 135 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 CWH43Q9H720 699 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 IL23AQ9NPF7 189 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 HESX1Q9UBX0 185 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ALG6Q9Y672 507 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP11A1P05108 521 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 TAF5Q15542 800 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 LIN9Q5TKA1 542 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 XYLT1Q86Y38 959 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 C18orf8Q96DM3 657 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 MCEEQ96PE7 176 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 KCNK16Q96T55 309 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 HOXA2O43364 376 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 GRAP2O75791 330 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 PEX26Q7Z412 305 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 METTL23Q86XA0 190 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 EMC1Q8N766 993 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-204ENST00000452765 COMTP21964 271 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 MARCKSL1P49006 195 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 OGDHQ02218 1023 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC43Q8N309 656 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 VCPIP1Q96JH7 1222 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-204ENST00000452765 MIS12Q9H081 205 aa22.08■■□□□ 1.12
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