RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 FUKQ8N0W3 1084 aa11.73□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC4A11Q8NBS3 891 aa11.73□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC150Q8NCX0 1101 aa11.73□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 ITFG1Q8TB96 612 aa11.73□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.73□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 HDAC7Q8WUI4 952 aa11.73□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 ING5Q8WYH8 240 aa11.73□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 BPIFA3Q9BQP9 254 aa11.73□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 ZSWIM1Q9BR11 485 aa11.73□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.73□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 PIDD1Q9HB75 910 aa11.73□□□□□ -0.53
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RPRD1B-202ENST00000449186 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa11.73□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
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RPRD1B-202ENST00000449186 ATAT1Q5SQI0 421 aa11.72□□□□□ -0.53
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RPRD1B-202ENST00000449186 SLC2A14Q8TDB8 520 aa11.72□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 TFAP2BQ92481 460 aa11.72□□□□□ -0.53
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RPRD1B-202ENST00000449186 KCNK16Q96T55 309 aa11.72□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 CORO1BQ9BR76 489 aa11.72□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 LRRC3Q9BY71 257 aa11.72□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 DOCK8Q8NF50 2099 aa11.72□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 GREB1Q4ZG55 1949 aa11.71□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 BECN2A8MW95 431 aa11.71□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 MOSPD3O75425 235 aa11.71□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 RHOP08100 348 aa11.71□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.533e-7■■■□□ 15.2
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RPRD1B-202ENST00000449186 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM35AQ86V20 835 aa11.71□□□□□ -0.53
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RPRD1B-202ENST00000449186 ZMIZ2Q8NF64 920 aa11.71□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.71□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11.71□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.71□□□□□ -0.53
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RPRD1B-202ENST00000449186 MYADMQ96S97 322 aa11.71□□□□□ -0.53
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RPRD1B-202ENST00000449186 MED10Q9BTT4 135 aa11.71□□□□□ -0.53
RPRD1B-202ENST00000449186 NT5C1AQ9BXI3 368 aa11.71□□□□□ -0.53
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RPRD1B-202ENST00000449186 NOL4O94818 638 aa11.7□□□□□ -0.54
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RPRD1B-202ENST00000449186 CEBPBP17676 345 aa11.7□□□□□ -0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 BRD2P25440 801 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 HOXA9P31269 272 aa11.7□□□□□ -0.54
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RPRD1B-202ENST00000449186 MTHFRP42898 656 aa11.7□□□□□ -0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 ALDH1A3P47895 512 aa11.7□□□□□ -0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 ZP2Q05996 745 aa11.7□□□□□ -0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 CETN1Q12798 172 aa11.7□□□□□ -0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 PLD1Q13393 1074 aa11.7□□□□□ -0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 SYCP1Q15431 976 aa11.7□□□□□ -0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.7□□□□□ -0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 TJAP1Q5JTD0 557 aa11.7□□□□□ -0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 PRSS36Q5K4E3 855 aa11.7□□□□□ -0.54
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