RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 GCNT4Q9P109 453 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.51□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 A0A0A0MRY4 1105 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 KPNA7A9QM74 516 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 K7EQS6 105 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 CAPNS1P04632 268 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 USP17L7P0C7H9 530 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 DGKEP52429 567 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 IRX4P78413 519 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 FOXC1Q12948 553 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 NR1H3Q13133 447 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 GAB4Q2WGN9 574 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 SPDYCQ5MJ68 293 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 PIP4P1Q86T03 277 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 SPATA18Q8TC71 538 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 LRRC15Q8TF66 581 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 SLC22A12Q96S37 553 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 ACBD6Q9BR61 282 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 REEP2Q9BRK0 252 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 DPP3Q9NY33 737 aa8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 CITO14578 2027 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 PATE3B3GLJ2 98 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 TNFRSF10BO14763 440 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 TRAK2O60296 914 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 PFKLP17858 780 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 SPINK2P20155 84 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 BCKDHBP21953 392 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 GBP1P32455 592 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 OPRD1P41143 372 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 P2RY2P41231 377 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 PNPLA4P41247 253 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 GPR15P49685 360 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 ACOT2P49753 483 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 CDR1P51861 262 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 TSPY1Q01534 308 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 LMAN2Q12907 356 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 ACAP1Q15027 740 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 CRY1Q16526 586 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 SV2CQ496J9 727 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 MYCT1Q8N699 235 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 CXorf38Q8TB03 319 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 FAM212AQ96EL1 285 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 AK8Q96MA6 479 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 CEP295NLQ96MC4 621 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 CYP2S1Q96SQ9 504 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 PARVGQ9HBI0 331 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 K7ENM7 598 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 GABRDO14764 452 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 IL18RAPO95256 599 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 CYP2F1P24903 491 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 ADSSP30520 456 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 HOXD12P35452 270 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 DPP6P42658 865 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 MAGEA11P43364 429 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 IFNAR2P48551 515 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 ZXDBP98169 803 aa8.48□□□□□ -1.05
LINC00578-201ENST00000439009 SEMA3BQ13214 749 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms