RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435497.1

LINC00028-201, long intergenic non-protein coding RNA 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00028, Length 587 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00028-201ENST00000435497 FAM84AQ96KN4 292 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 MYRFLQ96LU7 910 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 STRA6Q9BX79 667 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 EBF1Q9UH73 591 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 THADAQ6YHU6 1953 aa14.63□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 GIPC1O14908 333 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 HCRTO43612 131 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 GJB2P29033 226 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ABCD1P33897 745 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 DDIT3P35638 169 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 TSPY1Q01534 308 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 DMC1Q14565 340 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 EML3Q32P44 896 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 OSTM1Q86WC4 334 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 CD101Q93033 1021 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ACBD6Q9BR61 282 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 GCNT4Q9P109 453 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 INVSQ9Y283 1065 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 KIF3AQ9Y496 699 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.62□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 C4orf47A7E2U8 309 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 IL18RAPO95256 599 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 APBB3O95704 486 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 CAVIN2O95810 425 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 NEFLP07196 543 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 CREB5Q02930 508 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 USP4Q13107 963 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 USP49Q70CQ1 688 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 SFR1Q86XK3 245 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 CPA6Q8N4T0 437 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 TMX3Q96JJ7 454 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ZNF560Q96MR9 790 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 EDEM2Q9BV94 578 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ABCB6Q9NP58 842 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.61□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 PTPRDP23468 1912 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 C2orf78A6NCI8 922 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 H3BQV1 296 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 RHOBTB1O94844 696 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ITGB3P05106 788 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 PROS1P07225 676 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 USP17L7P0C7H9 530 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 PNPLA4P41247 253 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ZXDBP98169 803 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 PSMD2Q13200 908 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 POSTNQ15063 836 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ELF2Q15723 593 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 DYMQ7RTS9 669 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 EPSTI1Q96J88 318 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 TMEM206Q9H813 350 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 WASF3Q9UPY6 502 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 IGF2RP11717 2491 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 PI4KAP42356 2102 aa14.6□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 ZZEF1O43149 2961 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 K7EQS6 105 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 GABRDO14764 452 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 HUS1O60921 280 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 CKMP06732 381 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 OPRD1P41143 372 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 IFNAR2P48551 515 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 DGKEP52429 567 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 GAB4Q2WGN9 574 aa14.59□□□□□ -0.07
LINC00028-201ENST00000435497 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms