RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	ATF6	P18850	670 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	NTHL1	P78549	312 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	PPP3CA	Q08209	521 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	SMARCD2	Q92925	531 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	TASP1	Q9H6P5	420 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	RAB20	Q9NX57	234 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	NCAN	O14594	1321 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	TCF3	P15923	654 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	MAGEA9	P43362	315 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	ASPA	P45381	313 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	PRKCQ	Q04759	706 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	11.72	□□□□□ -0.53	4e-6	■■■□□ 15.1
UBXN7-205	ENST00000429160	ASIC4	Q96FT7	647 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	GLUL	P15104	373 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	GCLM	P48507	274 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	NLRP12	P59046	1061 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	ASB16	Q96NS5	453 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		11.72	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	MOSPD3	O75425	235 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIM49	P0CI25	452 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	FBXL6	Q8N531	539 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	THAP9	Q9H5L6	903 aa		11.71	□□□□□ -0.53
UBXN7-205	ENST00000429160	CLSTN1	O94985	981 aa		11.71	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	BMP6	P22004	513 aa		11.71	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CLCN5	P51795	746 aa		11.71	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		11.71	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC35C1	Q96A29	364 aa		11.71	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		11.71	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		11.71	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		11.71	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		11.71	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		11.71	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	F11	P03951	625 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	LMO2	P25791	158 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	GABRR2	P28476	465 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	FMO5	P49326	533 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP27A1	Q02318	531 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TEAD2	Q15562	447 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	PCED1B	Q96HM7	432 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	IER2	Q9BTL4	223 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	IL21	Q9HBE4	155 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	FCAR	P24071	287 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	GRIK1	P39086	918 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		11.7	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	CILP	O75339	1184 aa		11.69	□□□□□ -0.54
UBXN7-205	ENST00000429160	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54

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