RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 ADH1AP07327 375 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 ADORA2BP29275 332 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 GPR17Q13304 367 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 HAUS4Q9H6D7 363 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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HOXA4-202ENST00000428284 CLDN5O00501 218 aa21.87■■□□□ 1.09
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HOXA4-202ENST00000428284 KLRC2P26717 231 aa21.87■■□□□ 1.09
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HOXA4-202ENST00000428284 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.87■■□□□ 1.09
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HOXA4-202ENST00000428284 ARHGAP17Q68EM7 881 aa21.87■■□□□ 1.09
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HOXA4-202ENST00000428284 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.87■■□□□ 1.09
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HOXA4-202ENST00000428284 HGSNATQ68CP4 663 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 WDR59Q6PJI9 974 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 HESX1Q9UBX0 185 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 CDR2Q01850 454 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 ADCY1Q08828 1119 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 CNGA2Q16280 664 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 MEA1Q16626 185 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 FAM35AQ86V20 835 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF677Q86XU0 584 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 ATAD1Q8NBU5 361 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.85■■□□□ 1.09
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HOXA4-202ENST00000428284 GRIN2CQ14957 1233 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 TPGS2Q68CL5 300 aa21.84■■□□□ 1.09
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HOXA4-202ENST00000428284 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXA4-202ENST00000428284 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
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HOXA4-202ENST00000428284 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.84■■□□□ 1.09
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HOXA4-202ENST00000428284 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.83■■□□□ 1.09
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HOXA4-202ENST00000428284 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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HOXA4-202ENST00000428284 CYP2F1P24903 491 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 FMO1Q01740 532 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD52Q8NB46 1076 aa21.82■■□□□ 1.08
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HOXA4-202ENST00000428284 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
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