RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
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UBXN4-204ENST00000426921 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 CACNA1AO00555 2505 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 HCRTO43612 131 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 AVPR1AP37288 418 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 NRLP54845 237 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 DDR2Q16832 855 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 MON1AQ86VX9 555 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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UBXN4-204ENST00000426921 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
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UBXN4-204ENST00000426921 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 MAGEA11P43364 429 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 TNK2Q07912 1038 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 CCINQ13939 588 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 PSMD6Q15008 389 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 STKLD1Q8NE28 680 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 HINFPQ9BQA5 517 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 TDP1Q9NUW8 608 aa22.32■■□□□ 1.16
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UBXN4-204ENST00000426921 CDH9Q9ULB4 789 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 CCL26Q9Y258 94 aa22.32■■□□□ 1.16
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UBXN4-204ENST00000426921 CXCL12P48061 93 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 ME1P48163 572 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 CYP24A1Q07973 514 aa22.31■■□□□ 1.16
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UBXN4-204ENST00000426921 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 TXNDC8Q6A555 127 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.31■■□□□ 1.16
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UBXN4-204ENST00000426921 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 DCLK2Q8N568 766 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 CGRRF1Q99675 332 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 SYT15Q9BQS2 421 aa22.31■■□□□ 1.16
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UBXN4-204ENST00000426921 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
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UBXN4-204ENST00000426921 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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UBXN4-204ENST00000426921 TTC8Q8TAM2 541 aa22.3■■□□□ 1.16
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UBXN4-204ENST00000426921 CYP2J2P51589 502 aa22.29■■□□□ 1.16
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UBXN4-204ENST00000426921 SPATA17Q96L03 361 aa22.29■■□□□ 1.16
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UBXN4-204ENST00000426921 NCDNQ9UBB6 729 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 CEP250Q9BV73 2442 aa22.29■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 PTPRDP23468 1912 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 K7ESF4 209 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 CLIC2O15247 247 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 TACC1O75410 805 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 TNNI1P19237 187 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN4-204ENST00000426921 RUNX3Q13761 415 aa22.28■■□□□ 1.16
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