RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF276Q8N554 614 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SPIRE2Q8WWL2 714 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 FNBP1Q96RU3 617 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM121Q9BTD3 319 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ALOX15BO15296 676 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 GYG2O15488 501 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF862O60290 1169 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 VNN1O95497 513 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 IFNB1P01574 187 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT1P04264 644 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 CACNA2D1P54289 1103 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 AP1B1Q10567 949 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR72Q3MJ13 1102 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 MCF2L2Q86YR7 1114 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TRPM4Q8TD43 1214 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SENP7Q9BQF6 1050 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SYNCQ9H7C4 482 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PPCSQ9HAB8 311 aa19.25■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 GARTP22102 1010 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 CETN2P41208 172 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMC4P43686 418 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 POLE2P56282 527 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 GAD2Q05329 585 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 CUL2Q13617 745 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 RINLQ6ZS11 566 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 NLRX1Q86UT6 975 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SAMD3Q8N6K7 520 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 FEZF2Q8TBJ5 459 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 FGD4Q96M96 766 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TELO2Q9Y4R8 837 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SCINQ9Y6U3 715 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0G2JND7 137 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBED4O75132 1171 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TJP3O95049 919 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT76Q01546 638 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 MTM1Q13496 603 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 MTMR2Q13614 643 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 DTX3LQ8TDB6 740 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR60Q8WVS4 1066 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 GATA6Q92908 595 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 GABBR1Q9UBS5 961 aa19.24■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGEA13PA6NCF6 341 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 F8VP50 259 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SFNP31947 248 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 GPX6P59796 221 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PLCB3Q01970 1234 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC5A9Q2M3M2 681 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF20Q3BBV1 942 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 EFHC2Q5JST6 749 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SCARA3Q6AZY7 606 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 RCOR2Q8IZ40 523 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS52Q8N1B4 723 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 MCUR1Q96AQ8 359 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 RMDN3Q96TC7 470 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PARVAQ9NVD7 372 aa19.23■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SP4Q02446 784 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 MORF4L2Q15014 288 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PPFIBP2Q8ND30 876 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 VCPIP1Q96JH7 1222 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM55Q9BYV6 548 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 C10orf88Q9H8K7 445 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 IP6K2Q9UHH9 426 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 NFASCO94856 1347 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SGK1O00141 431 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 EXTL3O43909 919 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC6O75061 913 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SSTR1P30872 391 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 LIG4P49917 911 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 ARFIP2P53365 341 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 CLDN10P78369 228 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM72Q6ZMU5 477 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 CENPUQ71F23 418 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 TCP10LQ8TDR4 215 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 STMN2Q93045 179 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SKA1Q96BD8 255 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 MCEEQ96PE7 176 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 PDCD2LQ9BRP1 358 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 MANSC1Q9H8J5 431 aa19.22■□□□□ 0.67
RALGPS1-208ENST00000424082 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms