RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 TSC2P49815 1807 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 UNCXA6NJT0 531 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 DGAT1O75907 488 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 AMHP03971 560 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC6Q86X45 466 aa3.82□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 SDCBP2Q9H190 292 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 XRRA1Q6P2D8 792 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 VSIG1Q86XK7 387 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP57Q86XR8 500 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC125Q86Z20 511 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP120Q8N960 986 aa3.82□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 PLCD4Q9BRC7 762 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZHX3Q9H4I2 956 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PPCSQ9HAB8 311 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TTLL3Q9Y4R7 772 aa3.81□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 H3BNX3 289 aa3.81□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 CSH2P0DML3 217 aa3.81□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 CCNJLQ8IV13 435 aa3.81□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 SLC15A5A6NIM6 579 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR46O15213 610 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TOM1O60784 492 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDH1A2O94788 518 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 BST1Q10588 318 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CALCOCO2Q13137 446 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ARNTL2Q8WYA1 636 aa3.81□□□□□ -1.8
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