RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TTC22Q5TAA0 569 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANKRD45Q5TZF3 282 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FCRL6Q6DN72 434 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMCO3Q6UWJ1 677 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GATAD2AQ86YP4 633 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANKS4BQ8N8V4 417 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DTX3Q8N9I9 347 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NUP43Q8NFH3 380 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NETO1Q8TDF5 533 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF480Q8WV37 535 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DYDC2Q96IM9 177 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MFSD14AQ96MC6 490 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCDHAC1Q9H158 963 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LDAHQ9H6V9 325 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RXFP1Q9HBX9 757 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TBC1D23Q9NUY8 699 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 STOML1Q9UBI4 398 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DKK4Q9UBT3 224 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MID2Q9UJV3 735 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CA14Q9ULX7 337 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RICTORQ6R327 1708 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C9orf84Q5VXU9 1444 aa4.28□□□□□ -1.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FCHO1O14526 889 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIAA0355O15063 1070 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNPH1O43598 174 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPR32O75388 356 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZBTB7AO95365 584 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CD1AP06126 327 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PORP16435 677 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CHMP24386 653 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CRHR1P34998 444 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ACTN2P35609 894 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WNT3AP56704 352 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CD83Q01151 205 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SCAPQ12770 1279 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NFIAQ12857 509 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TCF15Q12870 199 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC12A1Q13621 1099 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAB32Q13637 225 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNF43Q68DV7 783 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CRTC1Q6UUV9 634 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NLRX1Q86UT6 975 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC28AQ8IWP9 274 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC191Q8NCU4 936 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GOLGA1Q92805 767 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TSPAN17Q96FV3 270 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PEX11GQ96HA9 241 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RADILQ96JH8 1075 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ITPAQ9BY32 194 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 USP44Q9H0E7 712 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EPS8L2Q9H6S3 715 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPR35Q9HC97 309 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LANCL2Q9NS86 450 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 USP40Q9NVE5 1235 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VPS28Q9UK41 221 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TBX20Q9UMR3 447 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TAF6LQ9Y6J9 622 aa4.27□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CPS1P31327 1500 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 H3BNC9 293 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPTLC2O15270 562 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GRM6O15303 877 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC43A1O75387 559 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SCGB1D1O95968 90 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANXA6P08133 673 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NR2F1P10589 423 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MST1P26927 711 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ABCD3P28288 659 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC6A4P31645 630 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLK1P49759 484 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDK7P50613 346 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GALK1P51570 392 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCR9P51686 369 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UCP3P55916 312 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CYP4F8P98187 520 aa4.26□□□□□ -1.73
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDC16Q13042 620 aa4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms